More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2020 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  53.74 
 
 
720 aa  635    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  55.02 
 
 
686 aa  638    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  55.02 
 
 
686 aa  637    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2357  translation initiation factor IF-2  65.81 
 
 
1101 aa  927    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  55.89 
 
 
688 aa  639    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  53.71 
 
 
1183 aa  924    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1867  translation initiation factor IF-2  54.99 
 
 
1038 aa  1016    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  57.64 
 
 
692 aa  644    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0592  translation initiation factor IF-2  55.84 
 
 
1176 aa  954    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  55.81 
 
 
1104 aa  941    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  48.24 
 
 
1128 aa  925    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
1030 aa  2042    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  57.46 
 
 
903 aa  655    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  55.11 
 
 
1042 aa  1023    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  54.62 
 
 
992 aa  973    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  55.85 
 
 
1005 aa  998    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16741  translation initiation factor IF-2  47.02 
 
 
1161 aa  910    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18951  translation initiation factor IF-2  60.37 
 
 
1183 aa  922    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  52.08 
 
 
1059 aa  983    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16851  translation initiation factor IF-2  66.32 
 
 
1114 aa  896    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  54.62 
 
 
992 aa  972    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16161  translation initiation factor IF-2  50.84 
 
 
1113 aa  981    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.446889  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  56.14 
 
 
739 aa  640    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04131  translation initiation factor IF-2  51.42 
 
 
1124 aa  981    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16981  translation initiation factor IF-2  47.67 
 
 
1126 aa  912    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  54.7 
 
 
686 aa  633  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  54.07 
 
 
705 aa  632  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  54.37 
 
 
686 aa  632  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  54.86 
 
 
686 aa  635  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  54.86 
 
 
686 aa  635  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  54.07 
 
 
705 aa  632  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  54.37 
 
 
686 aa  632  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  56.24 
 
 
688 aa  632  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  54.89 
 
 
884 aa  630  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  55.03 
 
 
732 aa  630  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  55.71 
 
 
689 aa  629  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  55.25 
 
 
971 aa  625  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  54.79 
 
 
679 aa  623  1e-177  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  54.79 
 
 
679 aa  623  1e-177  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  56.07 
 
 
883 aa  622  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  55.39 
 
 
888 aa  622  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  53.85 
 
 
686 aa  618  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  54.17 
 
 
1029 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  52.89 
 
 
860 aa  609  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  53.26 
 
 
1161 aa  611  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  52.58 
 
 
985 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  55.04 
 
 
980 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  54.87 
 
 
882 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  53.17 
 
 
986 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  54.56 
 
 
845 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  51.74 
 
 
882 aa  601  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  50.72 
 
 
947 aa  596  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  52.52 
 
 
822 aa  595  1e-168  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  53.33 
 
 
921 aa  595  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  52.45 
 
 
1079 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  53.04 
 
 
968 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  53.41 
 
 
924 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  49.28 
 
 
907 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  50.57 
 
 
920 aa  573  1.0000000000000001e-162  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  52.15 
 
 
949 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  54.61 
 
 
1035 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  48.44 
 
 
892 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  48.09 
 
 
962 aa  575  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  52.58 
 
 
673 aa  570  1e-161  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  51.86 
 
 
997 aa  570  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  50.4 
 
 
964 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  51.79 
 
 
894 aa  566  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  52.85 
 
 
1131 aa  566  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  50.48 
 
 
943 aa  568  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  52.2 
 
 
970 aa  568  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  50.4 
 
 
964 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  48.39 
 
 
956 aa  566  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  51.19 
 
 
656 aa  566  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  48.68 
 
 
752 aa  565  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  51.51 
 
 
880 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  51.51 
 
 
880 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  47.99 
 
 
943 aa  562  1.0000000000000001e-159  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  52.61 
 
 
984 aa  566  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  51.51 
 
 
880 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  49.76 
 
 
940 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  51.08 
 
 
843 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_118781  chloroplast translation initiation factor 2  48.96 
 
 
1053 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.106372 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  51.51 
 
 
880 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  49.44 
 
 
848 aa  565  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  48.58 
 
 
1058 aa  563  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  52.05 
 
 
984 aa  560  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 
904 aa  560  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  48.79 
 
 
922 aa  561  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  51.44 
 
 
880 aa  560  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  50.77 
 
 
1022 aa  561  1e-158  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  49.74 
 
 
936 aa  561  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  52.65 
 
 
979 aa  561  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0476  translation initiation factor IF-2  51.24 
 
 
602 aa  561  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258534  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  47.42 
 
 
945 aa  560  1e-158  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  46.68 
 
 
831 aa  560  1e-158  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  51.52 
 
 
1079 aa  562  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  50.84 
 
 
881 aa  560  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  50 
 
 
854 aa  560  1e-158  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  53.03 
 
 
941 aa  560  1e-158  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1230  translation initiation factor IF-2  52.2 
 
 
951 aa  557  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0683246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>