More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0592 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_16981  translation initiation factor IF-2  57.11 
 
 		 1126 aa  1217    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  64.11 
 
 		 1183 aa  1379    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1867  translation initiation factor IF-2  64.71 
 
 		 1038 aa  848    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  63.09 
 
 		 992 aa  819    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0592  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 1176 aa  2308    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  87.9 
 
 		 1104 aa  1570    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  58.61 
 
 		 1128 aa  1257    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  55.01 
 
 		 1030 aa  967    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  64.06 
 
 		 1042 aa  845    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2357  translation initiation factor IF-2  61.8 
 
 		 1101 aa  814    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16161  translation initiation factor IF-2  62.99 
 
 		 1113 aa  1380    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.446889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16851  translation initiation factor IF-2  57.49 
 
 		 1114 aa  1228    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18951  translation initiation factor IF-2  63.5 
 
 		 1183 aa  1391    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  62.89 
 
 		 1005 aa  849    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  63.13 
 
 		 1059 aa  845    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  63.09 
 
 		 992 aa  818    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04131  translation initiation factor IF-2  69.85 
 
 		 1124 aa  1486    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16741  translation initiation factor IF-2  56.64 
 
 		 1161 aa  1246    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  52.24 
 
 		 903 aa  617  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  53.19 
 
 		 971 aa  618  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  51.95 
 
 		 720 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  52.98 
 
 		 705 aa  615  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  52.98 
 
 		 705 aa  615  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  56.23 
 
 		 692 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  53.47 
 
 		 732 aa  610  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  53.85 
 
 		 739 aa  609  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  53.44 
 
 		 686 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  53.44 
 
 		 686 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  53.44 
 
 		 686 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  53.44 
 
 		 686 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  54.12 
 
 		 688 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  53.2 
 
 		 689 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  50.31 
 
 		 888 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  53.09 
 
 		 686 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  53.09 
 
 		 686 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  53.61 
 
 		 688 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  53.26 
 
 		 686 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  41.04 
 
 		 1029 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  53.68 
 
 		 985 aa  599  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  53.5 
 
 		 884 aa  597  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  53.42 
 
 		 679 aa  598  1e-169  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  53.42 
 
 		 679 aa  598  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  53.16 
 
 		 883 aa  595  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  53.46 
 
 		 1161 aa  593  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  52.56 
 
 		 882 aa  589  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  53.66 
 
 		 860 aa  592  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  52.03 
 
 		 686 aa  590  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  52.14 
 
 		 882 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  52.48 
 
 		 986 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  52.31 
 
 		 980 aa  582  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  51.88 
 
 		 822 aa  581  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_118781  chloroplast translation initiation factor 2  46.99 
 
 		 1053 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.106372 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  49.06 
 
 		 921 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  52.64 
 
 		 968 aa  572  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  52.41 
 
 		 964 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  50.93 
 
 		 907 aa  570  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  51.43 
 
 		 843 aa  572  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  52.75 
 
 		 964 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  51.89 
 
 		 924 aa  568  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  51.84 
 
 		 656 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 880 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  52.54 
 
 		 845 aa  560  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 880 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  53.74 
 
 		 975 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  51.73 
 
 		 984 aa  560  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  53.74 
 
 		 975 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 880 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 880 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  53.74 
 
 		 975 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  53.74 
 
 		 975 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  53.57 
 
 		 975 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  49.32 
 
 		 889 aa  556  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  53.57 
 
 		 975 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 		 1079 aa  556  1e-157  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 947 aa  559  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  53.4 
 
 		 976 aa  557  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  50.25 
 
 		 1131 aa  559  1e-157  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  53.57 
 
 		 975 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  52.04 
 
 		 964 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  48.61 
 
 		 896 aa  555  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 898 aa  555  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 896 aa  553  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 894 aa  555  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  53.06 
 
 		 969 aa  554  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  51.81 
 
 		 992 aa  555  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  50.76 
 
 		 922 aa  556  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  51.19 
 
 		 979 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  52.97 
 
 		 971 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  52.97 
 
 		 971 aa  555  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 885 aa  554  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  48.3 
 
 		 894 aa  553  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  46.41 
 
 		 945 aa  553  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  53.06 
 
 		 971 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  51.2 
 
 		 984 aa  553  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  50.26 
 
 		 880 aa  556  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  52.97 
 
 		 971 aa  555  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 880 aa  556  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  49.5 
 
 		 943 aa  553  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  52.62 
 
 		 966 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0874  translation initiation factor IF-2  50.52 
 
 		 593 aa  550  1e-155  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0133057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>