More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_118781 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009357  OSTLU_118781  chloroplast translation initiation factor 2  100 
 
 
1053 aa  2094    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.106372 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16161  translation initiation factor IF-2  47.13 
 
 
1113 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.446889  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  49.59 
 
 
1183 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18951  translation initiation factor IF-2  49.59 
 
 
1183 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0592  translation initiation factor IF-2  48.44 
 
 
1176 aa  568  1e-160  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2357  translation initiation factor IF-2  48.23 
 
 
1101 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  50.94 
 
 
992 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1867  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 
1038 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04131  translation initiation factor IF-2  47.76 
 
 
1124 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  50.94 
 
 
992 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  47.52 
 
 
1128 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  48.96 
 
 
1030 aa  561  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  48.95 
 
 
1005 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  48.03 
 
 
1104 aa  558  1e-157  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16741  translation initiation factor IF-2  44.72 
 
 
1161 aa  555  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  49.15 
 
 
1042 aa  555  1e-156  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16851  translation initiation factor IF-2  46.53 
 
 
1114 aa  548  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16981  translation initiation factor IF-2  46.04 
 
 
1126 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  46.75 
 
 
1059 aa  541  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  47.03 
 
 
1079 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  41.02 
 
 
897 aa  501  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  44.01 
 
 
964 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  43.96 
 
 
964 aa  503  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  47.36 
 
 
880 aa  496  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  44.08 
 
 
885 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  47.3 
 
 
885 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  46.22 
 
 
969 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  46.05 
 
 
975 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  46.05 
 
 
975 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  46.05 
 
 
976 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  46.05 
 
 
975 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  46.82 
 
 
843 aa  493  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  47.13 
 
 
889 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  47.02 
 
 
880 aa  492  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  47.02 
 
 
880 aa  492  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  45.88 
 
 
975 aa  492  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  46.04 
 
 
986 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  45.88 
 
 
975 aa  492  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  45.55 
 
 
972 aa  492  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  45.38 
 
 
971 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  47.02 
 
 
880 aa  492  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  42.92 
 
 
907 aa  491  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  45.88 
 
 
975 aa  492  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  46.3 
 
 
965 aa  492  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  41.18 
 
 
1008 aa  492  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  47.13 
 
 
885 aa  492  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  47.13 
 
 
885 aa  492  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  47.02 
 
 
880 aa  492  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  45.55 
 
 
971 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  47.21 
 
 
732 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  45.88 
 
 
975 aa  492  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  45.26 
 
 
848 aa  492  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  44.55 
 
 
882 aa  492  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  44.78 
 
 
964 aa  488  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  44.98 
 
 
984 aa  488  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  45.55 
 
 
972 aa  489  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  44.03 
 
 
904 aa  486  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0779  translation initiation factor IF-2  46.15 
 
 
837 aa  488  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679376  normal  0.0113763 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  42.57 
 
 
984 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  43.93 
 
 
903 aa  489  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  45.62 
 
 
989 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  45.21 
 
 
979 aa  489  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  47.13 
 
 
739 aa  489  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  45.38 
 
 
971 aa  489  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  45.38 
 
 
971 aa  489  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  45.79 
 
 
1079 aa  484  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  43.59 
 
 
992 aa  484  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0721  translation initiation factor IF-2  45.67 
 
 
843 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.467302  normal  0.0872602 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  45.91 
 
 
991 aa  483  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  45.66 
 
 
892 aa  484  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  45.08 
 
 
883 aa  485  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  46.77 
 
 
881 aa  484  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4577  translation initiation factor IF-2  44.96 
 
 
846 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126639  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  42.69 
 
 
834 aa  485  1e-135  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  45.55 
 
 
948 aa  482  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4712  translation initiation factor IF-2  44.96 
 
 
846 aa  483  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333126  normal  0.0123461 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  44.48 
 
 
889 aa  480  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4712  translation initiation factor IF-2  44.96 
 
 
842 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.940521  normal  0.658182 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  43.75 
 
 
896 aa  481  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  46.05 
 
 
966 aa  482  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  46.26 
 
 
884 aa  481  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  45.21 
 
 
968 aa  481  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  44.55 
 
 
943 aa  478  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  44.39 
 
 
943 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5462  translation initiation factor IF-2  46.35 
 
 
837 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  45.53 
 
 
896 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  44.03 
 
 
943 aa  477  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  43.71 
 
 
953 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  45.02 
 
 
692 aa  476  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  44.54 
 
 
1161 aa  479  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62760  translation initiation factor IF-2  46.35 
 
 
840 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0503522  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  45.32 
 
 
895 aa  478  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1749  translation initiation factor IF-2  44.16 
 
 
890 aa  477  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0133551  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0139  translation initiation factor IF-2  44.25 
 
 
908 aa  474  1e-132  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4180  translation initiation factor IF-2  45.21 
 
 
841 aa  476  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  44.67 
 
 
947 aa  475  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  42.74 
 
 
854 aa  476  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3608  translation initiation factor IF-2  45.67 
 
 
828 aa  474  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  44.96 
 
 
854 aa  475  1e-132  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  46.22 
 
 
831 aa  475  1e-132  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>