More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3976 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  54.97 
 
 		 688 aa  637    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16851  translation initiation factor IF-2  60.9 
 
 		 1114 aa  816    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  52.29 
 
 		 971 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  62.46 
 
 		 1183 aa  834    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1867  translation initiation factor IF-2  53.96 
 
 		 1038 aa  1014    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04131  translation initiation factor IF-2  63.46 
 
 		 1124 aa  849    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0592  translation initiation factor IF-2  58.73 
 
 		 1176 aa  838    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  63.29 
 
 		 1104 aa  843    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  55.94 
 
 		 739 aa  643    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  44.98 
 
 		 1128 aa  830    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  51.23 
 
 		 1030 aa  984    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  55.74 
 
 		 903 aa  652    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16741  translation initiation factor IF-2  60.98 
 
 		 1161 aa  820    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18951  translation initiation factor IF-2  60 
 
 		 1183 aa  833    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  100 
 
 		 1059 aa  2141    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  68.2 
 
 		 1042 aa  930    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  55.01 
 
 		 732 aa  636    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2357  translation initiation factor IF-2  51.44 
 
 		 1101 aa  975    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16981  translation initiation factor IF-2  60.59 
 
 		 1126 aa  811    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  54.38 
 
 		 686 aa  635  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  54.12 
 
 		 686 aa  632  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  54.12 
 
 		 686 aa  632  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  54.29 
 
 		 686 aa  634  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  53.7 
 
 		 686 aa  629  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  53.7 
 
 		 686 aa  629  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  54.45 
 
 		 688 aa  630  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  54.12 
 
 		 686 aa  631  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  53.06 
 
 		 705 aa  627  1e-178  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  53.06 
 
 		 705 aa  627  1e-178  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  52.89 
 
 		 720 aa  625  1e-177  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  55.29 
 
 		 888 aa  625  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  54.36 
 
 		 985 aa  625  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  53.61 
 
 		 689 aa  624  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  54.06 
 
 		 692 aa  622  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  50.15 
 
 		 1029 aa  617  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  54.68 
 
 		 882 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  53.74 
 
 		 679 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  53.74 
 
 		 679 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  50.98 
 
 		 686 aa  611  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  53.83 
 
 		 883 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  54.58 
 
 		 884 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  52.9 
 
 		 986 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  53.81 
 
 		 980 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  53.28 
 
 		 860 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  52.58 
 
 		 921 aa  601  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  51.12 
 
 		 1161 aa  598  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  53.33 
 
 		 822 aa  597  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  51.78 
 
 		 845 aa  593  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  49.38 
 
 		 882 aa  590  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  50.5 
 
 		 920 aa  586  1e-166  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  51.19 
 
 		 947 aa  587  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  49.76 
 
 		 907 aa  587  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  52.69 
 
 		 924 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  51.07 
 
 		 922 aa  582  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  51.99 
 
 		 656 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  53.15 
 
 		 949 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  48.42 
 
 		 943 aa  575  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  51.62 
 
 		 1131 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  51.55 
 
 		 962 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0983  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 		 593 aa  570  1e-161  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  48.63 
 
 		 943 aa  570  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  50.42 
 
 		 876 aa  570  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 936 aa  572  1e-161  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  53.23 
 
 		 941 aa  570  1e-161  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  50.51 
 
 		 968 aa  570  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_855  translation initiation factor 2 (IF-2)  50.26 
 
 		 593 aa  570  1e-161  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00962289  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0874  translation initiation factor IF-2  49.91 
 
 		 593 aa  567  1e-160  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0133057  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  49.19 
 
 		 964 aa  568  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  49.76 
 
 		 673 aa  568  1e-160  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  46.61 
 
 		 880 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0993  translation initiation factor IF-2  54.81 
 
 		 668 aa  568  1e-160  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000676499  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  49.19 
 
 		 964 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  51.02 
 
 		 843 aa  567  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  50.5 
 
 		 887 aa  567  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  46.61 
 
 		 880 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  48.81 
 
 		 945 aa  566  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  46.61 
 
 		 880 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  46.61 
 
 		 880 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  48.58 
 
 		 964 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 943 aa  565  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  46.17 
 
 		 880 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  49.13 
 
 		 904 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  50.09 
 
 		 894 aa  566  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  50.24 
 
 		 979 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 1079 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  50 
 
 		 949 aa  563  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  51.11 
 
 		 991 aa  563  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  50.09 
 
 		 885 aa  560  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 896 aa  560  1e-158  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  51.3 
 
 		 658 aa  559  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 		 895 aa  559  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  49.24 
 
 		 943 aa  562  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 854 aa  562  1e-158  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 		 911 aa  560  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  50.09 
 
 		 1022 aa  560  1e-158  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  51.26 
 
 		 976 aa  560  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  49.5 
 
 		 984 aa  561  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  48.98 
 
 		 956 aa  561  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 		 881 aa  560  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 		 892 aa  561  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>