More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1208 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  51.38 
 
 		 686 aa  671    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  57.95 
 
 		 845 aa  651    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  56.61 
 
 		 854 aa  642    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  54.64 
 
 		 739 aa  637    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  55.42 
 
 		 903 aa  648    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 658 aa  1304    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  57.12 
 
 		 822 aa  665    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  53.62 
 
 		 692 aa  684    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  54.15 
 
 		 732 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  54.62 
 
 		 1161 aa  626  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  47.59 
 
 		 679 aa  623  1e-177  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  47.59 
 
 		 679 aa  624  1e-177  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  47.18 
 
 		 686 aa  616  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  46.86 
 
 		 686 aa  615  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  46.86 
 
 		 686 aa  615  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  47.03 
 
 		 686 aa  615  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  47 
 
 		 686 aa  617  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  52.3 
 
 		 971 aa  616  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  51.76 
 
 		 883 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  46.71 
 
 		 686 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  46.75 
 
 		 689 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  53.4 
 
 		 884 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  46.71 
 
 		 686 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  53.65 
 
 		 882 aa  610  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  52.71 
 
 		 888 aa  612  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0993  translation initiation factor IF-2  46.59 
 
 		 668 aa  609  1e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000676499  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  53.51 
 
 		 985 aa  608  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  50.83 
 
 		 882 aa  611  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  52.74 
 
 		 860 aa  610  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  46.78 
 
 		 688 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  47.13 
 
 		 688 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  51.49 
 
 		 892 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  46.38 
 
 		 673 aa  604  1.0000000000000001e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 		 986 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  51.36 
 
 		 1029 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  45.14 
 
 		 720 aa  601  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  52.29 
 
 		 980 aa  596  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  51.91 
 
 		 997 aa  592  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  53.1 
 
 		 962 aa  593  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  54.15 
 
 		 928 aa  589  1e-167  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  50.57 
 
 		 921 aa  590  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  51.4 
 
 		 705 aa  588  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  51.4 
 
 		 705 aa  588  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  51.21 
 
 		 984 aa  587  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4217  translation initiation factor 2  52.04 
 
 		 1011 aa  585  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726068  normal  0.0540264 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  52.17 
 
 		 1079 aa  585  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  52.06 
 
 		 924 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  52.87 
 
 		 1079 aa  580  1e-164  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  51.2 
 
 		 947 aa  581  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0983  translation initiation factor IF-2  51.23 
 
 		 593 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  50.6 
 
 		 752 aa  577  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  46.37 
 
 		 689 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  51.24 
 
 		 949 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  51.74 
 
 		 940 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  51.38 
 
 		 920 aa  578  1.0000000000000001e-163  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  52.54 
 
 		 738 aa  577  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  55.44 
 
 		 1035 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_855  translation initiation factor 2 (IF-2)  50.88 
 
 		 593 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00962289  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3751  translation initiation factor IF-2  52.01 
 
 		 729 aa  572  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00372327  unclonable  0.0000243777 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 970 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0874  translation initiation factor IF-2  50.44 
 
 		 593 aa  571  1e-161  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0133057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0476  translation initiation factor IF-2  51.57 
 
 		 602 aa  570  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258534  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  50.26 
 
 		 907 aa  566  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  50.26 
 
 		 656 aa  566  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  49.74 
 
 		 882 aa  567  1e-160  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1230  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 		 951 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0683246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1162  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 		 946 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 896 aa  560  1e-158  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  51.46 
 
 		 879 aa  560  1e-158  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  49.06 
 
 		 711 aa  560  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  50.42 
 
 		 1059 aa  561  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3035  translation initiation factor IF-2  48.89 
 
 		 884 aa  560  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.19789  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  50.09 
 
 		 1058 aa  556  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 834 aa  558  1e-157  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  48.43 
 
 		 949 aa  556  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 922 aa  554  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1034  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 774 aa  555  1e-156  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  49.74 
 
 		 975 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  49.74 
 
 		 975 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  48.29 
 
 		 1030 aa  549  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  47.43 
 
 		 693 aa  550  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  48.95 
 
 		 979 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  55.38 
 
 		 1131 aa  550  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  49.74 
 
 		 975 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  49.74 
 
 		 975 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  48.85 
 
 		 896 aa  548  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  46.47 
 
 		 1005 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  48.34 
 
 		 853 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  49.57 
 
 		 975 aa  548  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  48.86 
 
 		 876 aa  547  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  49.57 
 
 		 975 aa  548  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  47.28 
 
 		 690 aa  547  1e-154  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  49.57 
 
 		 975 aa  548  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1865  translation initiation factor IF-2  46.6 
 
 		 692 aa  548  1e-154  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00943635  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  49.05 
 
 		 976 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1102  translation initiation factor IF-2  48.97 
 
 		 950 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.397412  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  48.88 
 
 		 969 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  49.12 
 
 		 989 aa  542  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  50.98 
 
 		 941 aa  543  1e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  47.38 
 
 		 879 aa  543  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>