More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1034 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  52.81 
 
 
949 aa  654    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  53.21 
 
 
986 aa  677    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  52.95 
 
 
883 aa  676    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  55.63 
 
 
896 aa  677    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  55.88 
 
 
692 aa  649    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  54.58 
 
 
947 aa  664    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0831  translation initiation factor IF-2  50.23 
 
 
882 aa  652    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.857351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  56.51 
 
 
884 aa  682    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1034  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
774 aa  1570    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  56.68 
 
 
882 aa  673    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  49.22 
 
 
903 aa  677    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  53.45 
 
 
860 aa  639    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  54.73 
 
 
822 aa  653    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  54.47 
 
 
997 aa  647    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  55 
 
 
732 aa  642    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  53.05 
 
 
980 aa  675    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  51.94 
 
 
985 aa  642    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  49.27 
 
 
971 aa  639    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  55.08 
 
 
739 aa  647    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  49.64 
 
 
1029 aa  654    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  54.15 
 
 
962 aa  641    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  51.08 
 
 
921 aa  647    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  53.39 
 
 
1079 aa  632  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  53.29 
 
 
1161 aa  634  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  50.9 
 
 
1058 aa  634  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  51.5 
 
 
892 aa  634  1e-180  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  49.93 
 
 
984 aa  627  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  54.53 
 
 
845 aa  628  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  52.57 
 
 
924 aa  628  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  47.79 
 
 
888 aa  622  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  54.24 
 
 
1079 aa  621  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  52.03 
 
 
940 aa  619  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  46.59 
 
 
882 aa  619  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  52.55 
 
 
689 aa  616  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  52.3 
 
 
686 aa  616  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  52.3 
 
 
686 aa  616  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  52.3 
 
 
686 aa  615  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  52.3 
 
 
686 aa  615  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  51.92 
 
 
945 aa  617  1e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  52.3 
 
 
686 aa  617  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  52.94 
 
 
720 aa  615  9.999999999999999e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  52.13 
 
 
686 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  51.61 
 
 
922 aa  614  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  52.13 
 
 
686 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  51.62 
 
 
907 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  52.3 
 
 
686 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  51.65 
 
 
879 aa  614  9.999999999999999e-175  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  51.27 
 
 
975 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  52.1 
 
 
688 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  52.14 
 
 
705 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  52.14 
 
 
705 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  51.27 
 
 
975 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  51.27 
 
 
975 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  50.6 
 
 
885 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  49.43 
 
 
959 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  51.1 
 
 
975 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  51.1 
 
 
975 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  50.59 
 
 
971 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  51.1 
 
 
975 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  49.76 
 
 
964 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  50.93 
 
 
989 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  51.1 
 
 
975 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  50.59 
 
 
971 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  51.1 
 
 
969 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  50.59 
 
 
971 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  45.84 
 
 
880 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  51.01 
 
 
964 aa  601  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  50.93 
 
 
986 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  50.59 
 
 
972 aa  601  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  52.1 
 
 
688 aa  602  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  55.5 
 
 
1035 aa  600  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  51.1 
 
 
976 aa  601  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  45.84 
 
 
880 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  50.69 
 
 
953 aa  601  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  45.84 
 
 
880 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  49.43 
 
 
990 aa  599  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  50.76 
 
 
856 aa  599  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  50.42 
 
 
971 aa  601  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  47.08 
 
 
882 aa  602  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  50.42 
 
 
972 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  45.84 
 
 
880 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 
965 aa  597  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 
894 aa  595  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 
943 aa  596  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  46.7 
 
 
885 aa  596  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  51.54 
 
 
887 aa  597  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 
896 aa  597  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  49.27 
 
 
956 aa  595  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  46.54 
 
 
889 aa  596  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 
896 aa  598  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 
970 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  47.04 
 
 
880 aa  597  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  48.87 
 
 
943 aa  592  1e-168  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  50.68 
 
 
964 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  50.26 
 
 
984 aa  595  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3035  translation initiation factor IF-2  50.41 
 
 
884 aa  594  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.19789  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4217  translation initiation factor 2  50.59 
 
 
1011 aa  592  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726068  normal  0.0540264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  46.67 
 
 
885 aa  595  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  46.67 
 
 
885 aa  595  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  51.56 
 
 
920 aa  594  1e-168  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>