More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3035 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  43.23 
 
 		 897 aa  641    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  48.4 
 
 		 883 aa  766    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  54.64 
 
 		 971 aa  659    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  52.31 
 
 		 896 aa  639    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3346  translation initiation factor IF-2  54.96 
 
 		 901 aa  650    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.12411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  54.31 
 
 		 889 aa  660    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  53.17 
 
 		 894 aa  645    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  55.27 
 
 		 896 aa  650    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  55.71 
 
 		 885 aa  660    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  58.76 
 
 		 1079 aa  694    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  46.46 
 
 		 940 aa  742    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  55.71 
 
 		 868 aa  652    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  55.54 
 
 		 868 aa  651    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3465  translation initiation factor IF-2  54.87 
 
 		 905 aa  647    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  55.4 
 
 		 891 aa  663    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  51.63 
 
 		 1058 aa  635    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  49.85 
 
 		 845 aa  635    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  52.31 
 
 		 686 aa  635    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  46.09 
 
 		 947 aa  743    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  54.81 
 
 		 894 aa  649    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01760  translation initiation factor IF-2  53.92 
 
 		 868 aa  652    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  49.4 
 
 		 884 aa  793    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  58.32 
 
 		 984 aa  701    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  51.71 
 
 		 1161 aa  636    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  54.82 
 
 		 892 aa  717    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  53.3 
 
 		 970 aa  642    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  55.06 
 
 		 902 aa  640    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  55.56 
 
 		 896 aa  658    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  44.03 
 
 		 903 aa  696    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  54.03 
 
 		 739 aa  652    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  58.63 
 
 		 997 aa  710    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  55.37 
 
 		 880 aa  654    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  44.8 
 
 		 907 aa  647    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3035  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 884 aa  1769    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.19789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  59.11 
 
 		 980 aa  745    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  55.56 
 
 		 884 aa  654    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0585  translation initiation factor IF-2  54.63 
 
 		 899 aa  650    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0808  translation initiation factor IF-2  54.8 
 
 		 900 aa  653    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.925902  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  55.37 
 
 		 880 aa  654    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  56.2 
 
 		 898 aa  649    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3993  translation initiation factor IF-2  54.23 
 
 		 884 aa  639    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3596  translation initiation factor IF-2  54.23 
 
 		 892 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000160504  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  53.67 
 
 		 869 aa  646    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  55.22 
 
 		 985 aa  653    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3730  translation initiation factor IF-2  54.23 
 
 		 892 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187768  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  55.98 
 
 		 845 aa  652    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42820  translation initiation factor IF-2  54.71 
 
 		 836 aa  640    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914178  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  54.69 
 
 		 853 aa  645    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  55.54 
 
 		 885 aa  657    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  55.54 
 
 		 885 aa  657    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  52.39 
 
 		 883 aa  638    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  54.87 
 
 		 881 aa  660    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  41.91 
 
 		 882 aa  687    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  53.86 
 
 		 732 aa  654    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  53.92 
 
 		 885 aa  662    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  53.5 
 
 		 895 aa  652    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  55.37 
 
 		 880 aa  654    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  55.29 
 
 		 692 aa  654    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  48.5 
 
 		 962 aa  802    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  51.94 
 
 		 949 aa  640    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  55.54 
 
 		 889 aa  658    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  55.37 
 
 		 880 aa  659    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  52.98 
 
 		 921 aa  712    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  47.96 
 
 		 882 aa  776    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  55.37 
 
 		 880 aa  654    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  59.11 
 
 		 986 aa  746    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  56.57 
 
 		 882 aa  662    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  52.43 
 
 		 880 aa  644    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  55 
 
 		 848 aa  638    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  58.76 
 
 		 1079 aa  715    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  56.67 
 
 		 949 aa  700    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  53.5 
 
 		 1029 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4712  translation initiation factor IF-2  53.44 
 
 		 846 aa  632  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333126  normal  0.0123461 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  51.69 
 
 		 720 aa  629  1e-179  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4577  translation initiation factor IF-2  53.44 
 
 		 846 aa  631  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1162  translation initiation factor IF-2  51.78 
 
 		 946 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0721  translation initiation factor IF-2  55.38 
 
 		 843 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.467302  normal  0.0872602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4712  translation initiation factor IF-2  55.38 
 
 		 842 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.940521  normal  0.658182 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  53.58 
 
 		 945 aa  630  1e-179  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  53.36 
 
 		 689 aa  629  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1230  translation initiation factor IF-2  51.78 
 
 		 951 aa  631  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0683246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  55.06 
 
 		 890 aa  628  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1749  translation initiation factor IF-2  53.07 
 
 		 890 aa  626  1e-178  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0133551  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  51.86 
 
 		 888 aa  625  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  53.62 
 
 		 686 aa  629  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  55.06 
 
 		 890 aa  628  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  53.45 
 
 		 686 aa  627  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3475  translation initiation factor IF-2  55.23 
 
 		 892 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02986  hypothetical protein  55.06 
 
 		 890 aa  628  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.201323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  52.68 
 
 		 688 aa  628  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  51.64 
 
 		 922 aa  625  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4489  translation initiation factor IF-2  55.06 
 
 		 890 aa  628  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3544  translation initiation factor IF-2  55.23 
 
 		 892 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3603  translation initiation factor IF-2  55.06 
 
 		 890 aa  628  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  55.06 
 
 		 890 aa  628  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3608  translation initiation factor IF-2  53.38 
 
 		 828 aa  627  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3476  translation initiation factor IF-2  55.23 
 
 		 892 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  53.02 
 
 		 686 aa  628  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0530  translation initiation factor IF-2  55.06 
 
 		 890 aa  628  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  decreased coverage  0.0000498988 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  53.62 
 
 		 686 aa  629  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>