More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0153 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 693 aa  1380    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0255  translation initiation factor IF-2  56.8 
 
 		 700 aa  782    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.405261  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1441  translation initiation factor IF-2  64.28 
 
 		 685 aa  863    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.155659  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  99.42 
 
 		 690 aa  1368    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1865  translation initiation factor IF-2  62.59 
 
 		 692 aa  841    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00943635  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  47.78 
 
 		 686 aa  613  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  46.9 
 
 		 692 aa  601  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  47.87 
 
 		 658 aa  580  1e-164  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  50.25 
 
 		 732 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 739 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  55.51 
 
 		 822 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  44.49 
 
 		 689 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  43.99 
 
 		 688 aa  556  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  44.49 
 
 		 673 aa  556  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  43.22 
 
 		 686 aa  552  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  43.36 
 
 		 686 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  43.36 
 
 		 686 aa  553  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  43.36 
 
 		 686 aa  554  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  43.36 
 
 		 686 aa  554  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  43.82 
 
 		 688 aa  554  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  42.94 
 
 		 686 aa  551  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  42.94 
 
 		 686 aa  551  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0993  translation initiation factor IF-2  44.27 
 
 		 668 aa  551  1e-155  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000676499  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  42.35 
 
 		 720 aa  547  1e-154  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  47.99 
 
 		 903 aa  548  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  43.4 
 
 		 689 aa  547  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  43.33 
 
 		 679 aa  548  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  43.33 
 
 		 679 aa  548  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  56.03 
 
 		 845 aa  546  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  53.35 
 
 		 985 aa  544  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  47.95 
 
 		 924 aa  533  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  52.57 
 
 		 854 aa  535  1e-150  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  47.07 
 
 		 1029 aa  533  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  46.37 
 
 		 971 aa  531  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  52.28 
 
 		 860 aa  530  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  51.47 
 
 		 1131 aa  526  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  47.39 
 
 		 907 aa  526  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  52.07 
 
 		 1161 aa  526  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  45.98 
 
 		 882 aa  528  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  48.39 
 
 		 964 aa  522  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  46.31 
 
 		 656 aa  522  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  48.72 
 
 		 936 aa  523  1e-147  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  48.31 
 
 		 968 aa  523  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  47.38 
 
 		 979 aa  524  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  46.89 
 
 		 888 aa  522  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2316  translation initiation factor IF-2  46.77 
 
 		 1116 aa  523  1e-147  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100815  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  47.72 
 
 		 964 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  47.88 
 
 		 964 aa  521  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  47.33 
 
 		 920 aa  521  1e-146  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  47.46 
 
 		 975 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  47.46 
 
 		 975 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  47.29 
 
 		 972 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  47.46 
 
 		 975 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  51.95 
 
 		 922 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  47.46 
 
 		 975 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  47.46 
 
 		 972 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  47.25 
 
 		 738 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  47.46 
 
 		 976 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  47.46 
 
 		 969 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  47.46 
 
 		 975 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  47.12 
 
 		 971 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  47.46 
 
 		 975 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  45.63 
 
 		 1059 aa  517  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  47.29 
 
 		 971 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  46.41 
 
 		 882 aa  516  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  47.46 
 
 		 975 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  47.12 
 
 		 971 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  47.06 
 
 		 920 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  53.08 
 
 		 911 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  47.1 
 
 		 882 aa  513  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  47.39 
 
 		 904 aa  515  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  48.46 
 
 		 915 aa  514  1e-144  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3751  translation initiation factor IF-2  47.25 
 
 		 729 aa  514  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00372327  unclonable  0.0000243777 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  47.37 
 
 		 884 aa  512  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  47.56 
 
 		 962 aa  512  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  47.12 
 
 		 971 aa  515  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_855  translation initiation factor 2 (IF-2)  47.24 
 
 		 593 aa  513  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00962289  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0983  translation initiation factor IF-2  46.77 
 
 		 593 aa  511  1e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  44.98 
 
 		 711 aa  509  1e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  47.72 
 
 		 966 aa  512  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  46.54 
 
 		 1030 aa  510  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  47.13 
 
 		 989 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0874  translation initiation factor IF-2  50.6 
 
 		 593 aa  510  1e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0133057  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  46.64 
 
 		 879 aa  512  1e-143  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  46.23 
 
 		 883 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  46.01 
 
 		 992 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3221  translation initiation factor IF-2  46.42 
 
 		 815 aa  508  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.109257 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0770  translation initiation factor IF-2  48.13 
 
 		 894 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  45.63 
 
 		 992 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  45.27 
 
 		 947 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  48.72 
 
 		 1022 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  47.13 
 
 		 986 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  52.39 
 
 		 948 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  46.18 
 
 		 1005 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  47.13 
 
 		 965 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  45.22 
 
 		 991 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  45.78 
 
 		 882 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  45.1 
 
 		 848 aa  506  9.999999999999999e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  52.13 
 
 		 986 aa  504  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42820  translation initiation factor IF-2  47.83 
 
 		 836 aa  504  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>