More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0255 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1865  translation initiation factor IF-2  55.33 
 
 		 692 aa  745    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00943635  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  56.37 
 
 		 693 aa  769    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  56.37 
 
 		 690 aa  768    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0255  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 700 aa  1401    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.405261  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1441  translation initiation factor IF-2  57.21 
 
 		 685 aa  776    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.155659  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  44.86 
 
 		 686 aa  588  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  44.59 
 
 		 692 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0993  translation initiation factor IF-2  42.02 
 
 		 668 aa  554  1e-156  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000676499  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  43.31 
 
 		 673 aa  547  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  46.67 
 
 		 822 aa  547  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  48.36 
 
 		 732 aa  545  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  47.68 
 
 		 739 aa  545  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  43.21 
 
 		 903 aa  541  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  45.47 
 
 		 882 aa  540  9.999999999999999e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  48.48 
 
 		 1029 aa  535  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  42.57 
 
 		 679 aa  538  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  42.57 
 
 		 679 aa  538  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  40.41 
 
 		 720 aa  533  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  43.65 
 
 		 658 aa  534  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  42.9 
 
 		 686 aa  529  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  42.51 
 
 		 689 aa  530  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  42.9 
 
 		 686 aa  528  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  42.47 
 
 		 686 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  42.76 
 
 		 686 aa  528  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  42.76 
 
 		 686 aa  528  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  42.47 
 
 		 686 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  42.9 
 
 		 686 aa  525  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  46.54 
 
 		 854 aa  528  1e-148  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  47.38 
 
 		 985 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  40.05 
 
 		 705 aa  525  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  40.05 
 
 		 705 aa  525  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  41.67 
 
 		 688 aa  519  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  41.53 
 
 		 688 aa  521  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  43.51 
 
 		 860 aa  513  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  42.43 
 
 		 888 aa  513  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  44.72 
 
 		 845 aa  511  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  42.79 
 
 		 947 aa  511  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  43.52 
 
 		 986 aa  510  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2316  translation initiation factor IF-2  45.13 
 
 		 1116 aa  511  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100815  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  44.54 
 
 		 856 aa  511  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  44.39 
 
 		 882 aa  512  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  44.8 
 
 		 971 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  43.2 
 
 		 980 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  42.74 
 
 		 752 aa  508  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  43.45 
 
 		 907 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  44.48 
 
 		 1161 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  43.15 
 
 		 949 aa  507  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  43.34 
 
 		 882 aa  504  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  42.9 
 
 		 848 aa  504  1e-141  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  42.54 
 
 		 884 aa  505  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  43.09 
 
 		 924 aa  503  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  44.89 
 
 		 738 aa  503  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  44.83 
 
 		 920 aa  499  1e-140  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  43.82 
 
 		 887 aa  501  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  44.89 
 
 		 1131 aa  497  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3751  translation initiation factor IF-2  44.39 
 
 		 729 aa  498  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00372327  unclonable  0.0000243777 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0770  translation initiation factor IF-2  45.67 
 
 		 894 aa  496  1e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  45.05 
 
 		 656 aa  497  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  44.18 
 
 		 892 aa  496  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  43.46 
 
 		 964 aa  498  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  42.26 
 
 		 883 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  42.26 
 
 		 1005 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  42.81 
 
 		 959 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  41.55 
 
 		 885 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  44.92 
 
 		 915 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  41.32 
 
 		 883 aa  493  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  44.81 
 
 		 962 aa  492  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  43.09 
 
 		 917 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  41.24 
 
 		 879 aa  489  1e-137  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  42.81 
 
 		 990 aa  490  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  42.33 
 
 		 979 aa  490  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  44.06 
 
 		 885 aa  489  1e-137  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  45.7 
 
 		 1079 aa  490  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  50.2 
 
 		 928 aa  491  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4387  translation initiation factor IF-2  43.09 
 
 		 917 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.582492 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0169  translation initiation factor IF-2  42.31 
 
 		 926 aa  488  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  48.02 
 
 		 922 aa  487  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  41.42 
 
 		 876 aa  487  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  43.64 
 
 		 997 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1034  translation initiation factor IF-2  44.58 
 
 		 774 aa  487  1e-136  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  43 
 
 		 834 aa  485  1e-136  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  40.39 
 
 		 882 aa  488  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_002936  DET0983  translation initiation factor IF-2  44.5 
 
 		 593 aa  482  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  44.41 
 
 		 952 aa  484  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0293  translation initiation factor IF-2  43 
 
 		 1083 aa  485  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00928073 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  42.63 
 
 		 886 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  42.35 
 
 		 835 aa  482  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  46.11 
 
 		 689 aa  482  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  43.59 
 
 		 936 aa  483  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  42.54 
 
 		 711 aa  483  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  44.24 
 
 		 911 aa  483  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  41.46 
 
 		 921 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  44.03 
 
 		 991 aa  484  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  42.81 
 
 		 968 aa  482  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  42.93 
 
 		 904 aa  480  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  44.26 
 
 		 1022 aa  482  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0398  translation initiation factor IF-2  45.35 
 
 		 986 aa  482  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0010836  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  41.31 
 
 		 989 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  42.29 
 
 		 964 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0433  translation initiation factor IF-2  43.6 
 
 		 829 aa  480  1e-134  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>