More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1254 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0169  translation initiation factor IF-2  67.77 
 
 		 926 aa  1064    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  52.35 
 
 		 883 aa  657    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  68.09 
 
 		 964 aa  1101    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  49.34 
 
 		 880 aa  649    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  55.54 
 
 		 887 aa  742    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  66.51 
 
 		 921 aa  863    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  62.6 
 
 		 838 aa  775    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2070  translation initiation factor IF-2  55.77 
 
 		 907 aa  716    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4387  translation initiation factor IF-2  62.55 
 
 		 917 aa  1102    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.582492 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  52.37 
 
 		 885 aa  652    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  54.84 
 
 		 898 aa  642    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  67.41 
 
 		 959 aa  1102    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  49.71 
 
 		 885 aa  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3727  translation initiation factor IF-2  62.74 
 
 		 971 aa  831    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.057525 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0033  translation initiation factor IF-2  57.85 
 
 		 1045 aa  778    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  49.77 
 
 		 880 aa  644    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2611  translation initiation factor IF-2  64.68 
 
 		 981 aa  847    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.709252  normal  0.107051 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  50.69 
 
 		 922 aa  641    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0024  translation initiation factor IF-2  66.88 
 
 		 871 aa  857    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  62.75 
 
 		 836 aa  775    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  49.77 
 
 		 880 aa  644    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2697  translation initiation factor IF-2  61.32 
 
 		 989 aa  817    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  53.58 
 
 		 884 aa  654    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  53.58 
 
 		 882 aa  642    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  53.61 
 
 		 986 aa  637    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3563  translation initiation factor IF-2  63.54 
 
 		 832 aa  799    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  57.78 
 
 		 873 aa  786    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  50.74 
 
 		 903 aa  654    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  49.63 
 
 		 980 aa  640    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  66.93 
 
 		 886 aa  855    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2490  translation initiation factor IF-2  51.06 
 
 		 875 aa  666    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0038  translation initiation factor IF-2  60.51 
 
 		 824 aa  771    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  64.52 
 
 		 880 aa  863    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  51.52 
 
 		 907 aa  648    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2819  translation initiation factor IF-2  61.47 
 
 		 990 aa  815    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  49.7 
 
 		 884 aa  644    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  54.07 
 
 		 883 aa  859    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1047  translation initiation factor IF-2  63.07 
 
 		 1053 aa  866    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0031  translation initiation factor IF-2  67.14 
 
 		 868 aa  860    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3816  translation initiation factor IF-2  53.38 
 
 		 856 aa  682    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134229  normal  0.0174936 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  62.72 
 
 		 835 aa  789    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0612  translation initiation factor IF-2  53.11 
 
 		 845 aa  668    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0968574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4618  translation initiation factor IF-2  64.37 
 
 		 975 aa  840    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0440  translation initiation factor IF-2  67.25 
 
 		 883 aa  856    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  79.21 
 
 		 856 aa  1036    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  62.6 
 
 		 836 aa  775    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  49.47 
 
 		 895 aa  635    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  48.81 
 
 		 896 aa  639    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  53.25 
 
 		 891 aa  638    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  50.37 
 
 		 885 aa  645    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  50.37 
 
 		 885 aa  645    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  77.76 
 
 		 885 aa  1083    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  49.24 
 
 		 881 aa  642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  49.77 
 
 		 880 aa  644    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0293  translation initiation factor IF-2  67.07 
 
 		 1083 aa  907    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00928073 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  49.77 
 
 		 880 aa  644    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  50.23 
 
 		 882 aa  651    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 848 aa  1721    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  78.77 
 
 		 917 aa  1050    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  50.94 
 
 		 949 aa  646    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  50.3 
 
 		 889 aa  644    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  67.3 
 
 		 990 aa  1102    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2923  translation initiation factor IF-2  61.32 
 
 		 989 aa  816    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.707465  normal  0.0820286 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2295  translation initiation factor IF-2  54.41 
 
 		 886 aa  899    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0792369 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  52.83 
 
 		 848 aa  802    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  52.17 
 
 		 875 aa  633  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  52.17 
 
 		 875 aa  633  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  49.84 
 
 		 894 aa  635  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  50.62 
 
 		 897 aa  629  1e-179  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  52.12 
 
 		 896 aa  631  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  52.74 
 
 		 894 aa  630  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0808  translation initiation factor IF-2  49.13 
 
 		 900 aa  628  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.925902  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  52.03 
 
 		 880 aa  629  1e-178  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  46.37 
 
 		 902 aa  626  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  51.58 
 
 		 947 aa  628  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0585  translation initiation factor IF-2  49.2 
 
 		 899 aa  628  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  51.45 
 
 		 848 aa  626  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  52.73 
 
 		 1029 aa  624  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  51.27 
 
 		 975 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  52.86 
 
 		 965 aa  624  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3346  translation initiation factor IF-2  51.41 
 
 		 901 aa  625  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.12411  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  51.11 
 
 		 975 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  51.6 
 
 		 853 aa  625  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  51.27 
 
 		 975 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  51.27 
 
 		 976 aa  623  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  51.11 
 
 		 975 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  53.02 
 
 		 971 aa  623  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  51.38 
 
 		 989 aa  622  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  51.92 
 
 		 979 aa  625  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  51.27 
 
 		 975 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  51.27 
 
 		 975 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  53.2 
 
 		 985 aa  623  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0530  translation initiation factor IF-2  53.04 
 
 		 890 aa  619  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  decreased coverage  0.0000498988 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  51.69 
 
 		 868 aa  621  1e-176  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  51.53 
 
 		 868 aa  619  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  52 
 
 		 968 aa  621  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3603  translation initiation factor IF-2  53.04 
 
 		 890 aa  619  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3544  translation initiation factor IF-2  53.21 
 
 		 892 aa  621  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  53.79 
 
 		 992 aa  622  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4489  translation initiation factor IF-2  53.04 
 
 		 890 aa  619  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>