More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0433 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  55.61 
 
 		 720 aa  659    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  57.95 
 
 		 686 aa  674    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  60.47 
 
 		 927 aa  700    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  61.24 
 
 		 752 aa  857    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  57.61 
 
 		 686 aa  671    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  57.61 
 
 		 686 aa  671    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  57.61 
 
 		 686 aa  671    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  56.73 
 
 		 688 aa  666    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  59.83 
 
 		 739 aa  709    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  57.61 
 
 		 686 aa  671    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  57.61 
 
 		 686 aa  671    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  56.48 
 
 		 705 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  57.95 
 
 		 686 aa  674    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  56.48 
 
 		 705 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  57.09 
 
 		 688 aa  667    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  60.07 
 
 		 732 aa  718    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  57.44 
 
 		 689 aa  672    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0817  translation initiation factor IF-2  53.08 
 
 		 950 aa  689    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0433  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 829 aa  1689    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  63.15 
 
 		 882 aa  783    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  58.84 
 
 		 834 aa  962    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  62.06 
 
 		 943 aa  723    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  57.41 
 
 		 860 aa  655    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  53.38 
 
 		 1161 aa  622  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  47.86 
 
 		 985 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  52.49 
 
 		 980 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  52.99 
 
 		 822 aa  607  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  43.12 
 
 		 882 aa  607  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  50.94 
 
 		 947 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  52.14 
 
 		 986 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  50.92 
 
 		 903 aa  603  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  52.14 
 
 		 971 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  52.08 
 
 		 1029 aa  595  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  52.84 
 
 		 845 aa  595  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  49.43 
 
 		 882 aa  589  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  49.51 
 
 		 883 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  51.65 
 
 		 948 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  50.43 
 
 		 884 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  51.3 
 
 		 692 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  50.86 
 
 		 679 aa  581  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  50.86 
 
 		 679 aa  581  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  53.98 
 
 		 1035 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  51.23 
 
 		 949 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  50.43 
 
 		 921 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  49.33 
 
 		 943 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 		 920 aa  571  1e-161  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  41.9 
 
 		 907 aa  572  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  50.87 
 
 		 879 aa  569  1e-161  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  49.17 
 
 		 943 aa  570  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  50.78 
 
 		 904 aa  567  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  48.26 
 
 		 968 aa  568  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  50.35 
 
 		 949 aa  566  1e-160  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  50.78 
 
 		 1079 aa  567  1e-160  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  49.48 
 
 		 888 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  50.09 
 
 		 945 aa  565  1.0000000000000001e-159  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  52.36 
 
 		 984 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  49.91 
 
 		 979 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  49.74 
 
 		 943 aa  562  1.0000000000000001e-159  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  47.74 
 
 		 943 aa  565  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  49.91 
 
 		 992 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  50.52 
 
 		 686 aa  561  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 924 aa  560  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  49.66 
 
 		 892 aa  559  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  49.91 
 
 		 984 aa  561  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  50.43 
 
 		 673 aa  558  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  49.39 
 
 		 964 aa  556  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  48.02 
 
 		 968 aa  558  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  49.57 
 
 		 953 aa  558  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  49.13 
 
 		 854 aa  553  1e-156  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  48.42 
 
 		 896 aa  554  1e-156  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  49.02 
 
 		 1131 aa  554  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl295  translation initiation factor IF-2  48.08 
 
 		 629 aa  555  1e-156  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000364465  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  46.3 
 
 		 873 aa  554  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2134  translation initiation factor IF-2  49.3 
 
 		 978 aa  553  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149988  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  49.48 
 
 		 964 aa  555  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  46.69 
 
 		 1008 aa  553  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  49.48 
 
 		 964 aa  555  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  48.35 
 
 		 875 aa  551  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2316  translation initiation factor IF-2  47.15 
 
 		 1116 aa  551  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100815  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  49.74 
 
 		 991 aa  551  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0141  translation initiation factor IF-2  48.55 
 
 		 1010 aa  549  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  47.44 
 
 		 989 aa  551  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 997 aa  551  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  48.35 
 
 		 875 aa  551  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  47.6 
 
 		 986 aa  551  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  47.03 
 
 		 975 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  48.7 
 
 		 959 aa  548  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  47.03 
 
 		 975 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  47.03 
 
 		 975 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  48.34 
 
 		 876 aa  548  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3221  translation initiation factor IF-2  47.01 
 
 		 815 aa  546  1e-154  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.109257 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  48.7 
 
 		 990 aa  548  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  51.99 
 
 		 1079 aa  547  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  47.03 
 
 		 975 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14570  translation initiation factor 2  50.17 
 
 		 938 aa  546  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00182457  normal  0.54145 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 		 929 aa  546  1e-154  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  50.36 
 
 		 962 aa  547  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  49.48 
 
 		 887 aa  548  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  50.42 
 
 		 879 aa  546  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  46.71 
 
 		 971 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>