More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0817 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  61.29 
 
 		 720 aa  734    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  61.63 
 
 		 686 aa  730    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  76.09 
 
 		 927 aa  926    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  61.63 
 
 		 686 aa  731    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  61.12 
 
 		 686 aa  725    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  61.46 
 
 		 686 aa  727    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  61.46 
 
 		 686 aa  727    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  61.8 
 
 		 689 aa  731    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  62.14 
 
 		 739 aa  747    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  60.61 
 
 		 705 aa  722    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  63.03 
 
 		 732 aa  761    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  61.12 
 
 		 686 aa  725    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  51.11 
 
 		 985 aa  657    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  60.61 
 
 		 705 aa  722    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  60.44 
 
 		 688 aa  721    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  58.67 
 
 		 860 aa  674    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  60.94 
 
 		 686 aa  726    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  60.1 
 
 		 688 aa  723    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0817  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 950 aa  1923    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0433  translation initiation factor IF-2  58.49 
 
 		 829 aa  700    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  61.81 
 
 		 882 aa  767    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  57.62 
 
 		 834 aa  751    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  71.45 
 
 		 943 aa  926    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  57.02 
 
 		 752 aa  803    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  54.84 
 
 		 971 aa  628  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  53.57 
 
 		 1161 aa  621  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  52.19 
 
 		 1029 aa  611  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  52.81 
 
 		 679 aa  610  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  52.81 
 
 		 679 aa  610  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  39.13 
 
 		 882 aa  610  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  52.48 
 
 		 920 aa  609  1e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  54.09 
 
 		 845 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  51.72 
 
 		 822 aa  602  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  48.66 
 
 		 922 aa  598  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  52.84 
 
 		 947 aa  596  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  45.92 
 
 		 903 aa  597  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  54.92 
 
 		 1131 aa  596  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  54.29 
 
 		 1035 aa  596  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  52.42 
 
 		 692 aa  594  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  50.25 
 
 		 896 aa  595  1e-168  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  52.94 
 
 		 686 aa  592  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  49.52 
 
 		 888 aa  591  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  48.22 
 
 		 907 aa  591  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  52.02 
 
 		 711 aa  589  1e-167  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  45.99 
 
 		 986 aa  587  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  50.25 
 
 		 883 aa  586  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  45.91 
 
 		 980 aa  586  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  47.14 
 
 		 896 aa  586  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  51.71 
 
 		 924 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  48.47 
 
 		 884 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  42.45 
 
 		 964 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  48.3 
 
 		 894 aa  581  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  47.57 
 
 		 882 aa  580  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  51.47 
 
 		 921 aa  580  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  48.52 
 
 		 990 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  42.53 
 
 		 959 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  50.26 
 
 		 879 aa  572  1.0000000000000001e-162  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  52.36 
 
 		 936 aa  575  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 		 738 aa  573  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  50.69 
 
 		 898 aa  571  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  49.77 
 
 		 964 aa  572  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  50.57 
 
 		 969 aa  570  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  48.6 
 
 		 979 aa  572  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  47.42 
 
 		 881 aa  570  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  52.41 
 
 		 929 aa  571  1e-161  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  48.63 
 
 		 885 aa  572  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 1079 aa  570  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  51.46 
 
 		 673 aa  566  1e-160  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  50.24 
 
 		 972 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  50.24 
 
 		 975 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  50.24 
 
 		 975 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  50.24 
 
 		 975 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  44.95 
 
 		 984 aa  568  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  50.24 
 
 		 975 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  48.62 
 
 		 971 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  47.58 
 
 		 895 aa  567  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  48.62 
 
 		 971 aa  569  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  42.15 
 
 		 968 aa  566  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  48.54 
 
 		 894 aa  568  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0476  translation initiation factor IF-2  51.27 
 
 		 602 aa  567  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258534  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  50.24 
 
 		 971 aa  568  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  48.62 
 
 		 971 aa  569  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3751  translation initiation factor IF-2  50.68 
 
 		 729 aa  569  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00372327  unclonable  0.0000243777 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  47.72 
 
 		 882 aa  568  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  50.77 
 
 		 949 aa  568  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0255  translation initiation factor IF-2  41.18 
 
 		 979 aa  565  1.0000000000000001e-159  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  46.39 
 
 		 889 aa  563  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  47.27 
 
 		 880 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  49.28 
 
 		 948 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  51.31 
 
 		 911 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 885 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  49.51 
 
 		 965 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  46.96 
 
 		 880 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 976 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  49.27 
 
 		 989 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  46.25 
 
 		 884 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  48.13 
 
 		 843 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 975 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  48.26 
 
 		 964 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  40.5 
 
 		 956 aa  564  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>