More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3441 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  46.88 
 
 		 890 aa  643    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  46.88 
 
 		 890 aa  643    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  46.4 
 
 		 883 aa  678    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  52.54 
 
 		 880 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  44.75 
 
 		 894 aa  669    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  56.38 
 
 		 898 aa  655    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3816  translation initiation factor IF-2  54.75 
 
 		 856 aa  719    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134229  normal  0.0174936 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  58.59 
 
 		 887 aa  769    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3464  translation initiation factor IF-2  46.88 
 
 		 890 aa  641    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345648 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2295  translation initiation factor IF-2  58.49 
 
 		 886 aa  952    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0792369 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  54.87 
 
 		 971 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0440  translation initiation factor IF-2  58.73 
 
 		 883 aa  932    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  53.06 
 
 		 880 aa  640    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  46.88 
 
 		 890 aa  643    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2697  translation initiation factor IF-2  63.18 
 
 		 989 aa  820    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3727  translation initiation factor IF-2  64.89 
 
 		 971 aa  851    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.057525 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  53.41 
 
 		 894 aa  643    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  54.28 
 
 		 975 aa  637    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  51.29 
 
 		 986 aa  675    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4489  translation initiation factor IF-2  46.88 
 
 		 890 aa  643    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  46.88 
 
 		 890 aa  643    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2611  translation initiation factor IF-2  66.26 
 
 		 981 aa  861    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.709252  normal  0.107051 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2819  translation initiation factor IF-2  60.54 
 
 		 990 aa  820    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  86.5 
 
 		 917 aa  1172    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0293  translation initiation factor IF-2  65.52 
 
 		 1083 aa  948    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00928073 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  56.44 
 
 		 949 aa  651    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  54.28 
 
 		 975 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  51.87 
 
 		 922 aa  659    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0024  translation initiation factor IF-2  71 
 
 		 871 aa  897    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  46.85 
 
 		 891 aa  654    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02986  hypothetical protein  46.88 
 
 		 890 aa  643    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.201323  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1047  translation initiation factor IF-2  62.36 
 
 		 1053 aa  905    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  64.79 
 
 		 836 aa  797    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  55.54 
 
 		 947 aa  664    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  52.54 
 
 		 880 aa  637    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0585  translation initiation factor IF-2  47.89 
 
 		 899 aa  641    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  64.95 
 
 		 836 aa  798    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  49.27 
 
 		 902 aa  655    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  56.83 
 
 		 884 aa  685    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  69.2 
 
 		 887 aa  889    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  54.28 
 
 		 975 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0808  translation initiation factor IF-2  48.12 
 
 		 900 aa  640    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.925902  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3603  translation initiation factor IF-2  46.88 
 
 		 890 aa  642    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  59.57 
 
 		 873 aa  811    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  54.88 
 
 		 903 aa  659    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4618  translation initiation factor IF-2  64.02 
 
 		 975 aa  860    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  48.93 
 
 		 882 aa  676    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  58.63 
 
 		 886 aa  919    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2490  translation initiation factor IF-2  53.89 
 
 		 875 aa  699    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  56.34 
 
 		 921 aa  927    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  50.88 
 
 		 895 aa  649    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  54.62 
 
 		 965 aa  636    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  60.24 
 
 		 880 aa  952    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  51.67 
 
 		 907 aa  658    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3346  translation initiation factor IF-2  47.42 
 
 		 901 aa  644    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.12411  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  52.73 
 
 		 884 aa  638    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  58.83 
 
 		 883 aa  926    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  54.11 
 
 		 964 aa  637    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0031  translation initiation factor IF-2  70.95 
 
 		 868 aa  894    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0530  translation initiation factor IF-2  46.88 
 
 		 890 aa  643    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  decreased coverage  0.0000498988 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  53.5 
 
 		 979 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  72.91 
 
 		 964 aa  1192    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 885 aa  1772    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  63.53 
 
 		 835 aa  825    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0612  translation initiation factor IF-2  57.03 
 
 		 845 aa  711    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0968574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2070  translation initiation factor IF-2  55.3 
 
 		 907 aa  737    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  53.9 
 
 		 882 aa  645    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0033  translation initiation factor IF-2  52.96 
 
 		 1045 aa  798    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  72.23 
 
 		 856 aa  1147    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  45.81 
 
 		 854 aa  639    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3563  translation initiation factor IF-2  65.08 
 
 		 832 aa  820    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0169  translation initiation factor IF-2  74.36 
 
 		 926 aa  1289    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  55.82 
 
 		 831 aa  639    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  66.29 
 
 		 848 aa  1152    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  52.88 
 
 		 885 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  52.88 
 
 		 885 aa  635    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  52.73 
 
 		 881 aa  643    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  53.41 
 
 		 896 aa  644    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  53.58 
 
 		 896 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  52.82 
 
 		 980 aa  676    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  54.11 
 
 		 964 aa  638    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  53.75 
 
 		 885 aa  652    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  64.95 
 
 		 838 aa  795    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  52.54 
 
 		 880 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2923  translation initiation factor IF-2  63.18 
 
 		 989 aa  820    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.707465  normal  0.0820286 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  50.49 
 
 		 985 aa  660    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  51.1 
 
 		 949 aa  635    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  52.88 
 
 		 889 aa  636    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  54.28 
 
 		 975 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  52.54 
 
 		 880 aa  637    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  54.03 
 
 		 921 aa  663    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4387  translation initiation factor IF-2  76.14 
 
 		 917 aa  1308    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.582492 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  54.49 
 
 		 848 aa  818    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  54.12 
 
 		 975 aa  635  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  52.88 
 
 		 885 aa  635  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3475  translation initiation factor IF-2  54.64 
 
 		 892 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3581  translation initiation factor IF-2  54.64 
 
 		 892 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.544549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  53.33 
 
 		 989 aa  634  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  51 
 
 		 968 aa  634  1e-180  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  54.12 
 
 		 975 aa  635  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>