More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1227 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  49.68 
 
 		 890 aa  778    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  49.68 
 
 		 890 aa  778    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  55.12 
 
 		 883 aa  653    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3993  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 884 aa  786    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1600  translation initiation factor IF-2  63.79 
 
 		 803 aa  763    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0215539  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0563  translation initiation factor IF-2  63.79 
 
 		 816 aa  764    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.852622  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1315  translation initiation factor IF-2  61.66 
 
 		 868 aa  729    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  72.13 
 
 		 964 aa  1009    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  53.69 
 
 		 887 aa  643    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  59.19 
 
 		 889 aa  738    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  76.69 
 
 		 975 aa  1006    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  49.68 
 
 		 890 aa  778    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  75.99 
 
 		 972 aa  998    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  60.7 
 
 		 885 aa  784    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4490  translation initiation factor IF-2  63.41 
 
 		 841 aa  748    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0593821  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  70.95 
 
 		 965 aa  1000    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  60.82 
 
 		 896 aa  775    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  48.81 
 
 		 854 aa  782    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  76.53 
 
 		 975 aa  1005    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  61.86 
 
 		 868 aa  767    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  61.86 
 
 		 868 aa  766    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4180  translation initiation factor IF-2  63.58 
 
 		 841 aa  751    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  46.74 
 
 		 908 aa  750    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  71.99 
 
 		 904 aa  965    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  76.69 
 
 		 975 aa  1006    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  58.74 
 
 		 898 aa  749    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  73.51 
 
 		 966 aa  999    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  68.35 
 
 		 922 aa  915    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  60.65 
 
 		 895 aa  753    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  58.96 
 
 		 943 aa  994    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  76.69 
 
 		 975 aa  1006    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  51.1 
 
 		 845 aa  795    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0779  translation initiation factor IF-2  58.26 
 
 		 837 aa  754    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679376  normal  0.0113763 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  51.77 
 
 		 836 aa  639    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  54.4 
 
 		 947 aa  663    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  74.1 
 
 		 972 aa  1010    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2697  translation initiation factor IF-2  53.24 
 
 		 989 aa  641    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3605  translation initiation factor IF-2  48.68 
 
 		 898 aa  783    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600034  normal  0.0461803 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  54.8 
 
 		 884 aa  647    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1123  translation initiation factor IF-2  58.31 
 
 		 818 aa  696    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3596  translation initiation factor IF-2  49.78 
 
 		 892 aa  781    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000160504  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1749  translation initiation factor IF-2  60.1 
 
 		 890 aa  717    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0133551  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  58.56 
 
 		 876 aa  969    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  56.64 
 
 		 873 aa  646    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1093  translation initiation factor IF-2  90.87 
 
 		 917 aa  1535    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  72.74 
 
 		 976 aa  1007    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  51.93 
 
 		 838 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3563  translation initiation factor IF-2  55.86 
 
 		 832 aa  640    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  49.95 
 
 		 894 aa  802    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0530  translation initiation factor IF-2  49.68 
 
 		 890 aa  778    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  decreased coverage  0.0000498988 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2134  translation initiation factor IF-2  59.44 
 
 		 978 aa  979    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149988  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2708  translation initiation factor IF-2  59.83 
 
 		 908 aa  689    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.334172  normal  0.377403 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  58.3 
 
 		 953 aa  984    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  59.22 
 
 		 907 aa  1010    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  69.16 
 
 		 968 aa  942    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  73.84 
 
 		 989 aa  998    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  74.42 
 
 		 969 aa  1014    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  49.68 
 
 		 890 aa  778    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  46.64 
 
 		 908 aa  751    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  65.14 
 
 		 979 aa  1147    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0631  translation initiation factor IF2-2  43.34 
 
 		 880 aa  704    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  60.15 
 
 		 880 aa  779    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  73.99 
 
 		 971 aa  1015    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  73.99 
 
 		 971 aa  1016    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  69.06 
 
 		 992 aa  958    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  55.32 
 
 		 882 aa  646    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  61.44 
 
 		 869 aa  746    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  66.52 
 
 		 991 aa  889    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  62.09 
 
 		 896 aa  768    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3464  translation initiation factor IF-2  49.46 
 
 		 890 aa  779    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345648 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  45.38 
 
 		 905 aa  716    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  59.42 
 
 		 943 aa  1029    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  60.24 
 
 		 885 aa  782    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  60.24 
 
 		 885 aa  782    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  59.12 
 
 		 883 aa  736    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4712  translation initiation factor IF-2  63.76 
 
 		 842 aa  751    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.940521  normal  0.658182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0721  translation initiation factor IF-2  64.09 
 
 		 843 aa  752    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.467302  normal  0.0872602 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  74.2 
 
 		 971 aa  1015    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62760  translation initiation factor IF-2  65.09 
 
 		 840 aa  762    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0503522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  76.53 
 
 		 975 aa  1005    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  76.53 
 
 		 975 aa  1005    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  51.93 
 
 		 836 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 920 aa  1829    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2749  translation initiation factor IF-2  66.82 
 
 		 990 aa  873    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.867679  normal  0.130193 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0179  translation initiation factor IF-2  55.18 
 
 		 892 aa  695    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.61877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  73.99 
 
 		 971 aa  1016    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3730  translation initiation factor IF-2  49.78 
 
 		 892 aa  781    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187768  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  55.33 
 
 		 949 aa  653    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  60.55 
 
 		 889 aa  783    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3608  translation initiation factor IF-2  62.99 
 
 		 828 aa  760    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  76.53 
 
 		 975 aa  1005    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  48.96 
 
 		 921 aa  640    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0203  translation initiation factor IF-2  45.29 
 
 		 892 aa  724    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.665385  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  55.44 
 
 		 848 aa  638    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  62.2 
 
 		 885 aa  788    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  60.22 
 
 		 882 aa  783    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  60.66 
 
 		 894 aa  776    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  50.54 
 
 		 880 aa  802    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  66.35 
 
 		 948 aa  942    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  60.91 
 
 		 848 aa  729    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>