More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3681 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  53.52 
 
 		 985 aa  639    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  55.56 
 
 		 883 aa  643    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3681  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 753 aa  1519    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00576781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  75.75 
 
 		 738 aa  927    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  55.56 
 
 		 986 aa  645    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  48.2 
 
 		 860 aa  637    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  48.23 
 
 		 903 aa  648    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  54.87 
 
 		 980 aa  639    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0476  translation initiation factor IF-2  68.67 
 
 		 602 aa  846    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258534  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  44.16 
 
 		 1029 aa  641    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  55.97 
 
 		 692 aa  649    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3751  translation initiation factor IF-2  75 
 
 		 729 aa  924    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00372327  unclonable  0.0000243777 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  55.56 
 
 		 656 aa  671    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  52.75 
 
 		 884 aa  634  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  54.33 
 
 		 971 aa  634  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  47.49 
 
 		 888 aa  634  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  48.12 
 
 		 921 aa  632  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  53.64 
 
 		 882 aa  625  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  55.25 
 
 		 739 aa  626  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  55.85 
 
 		 845 aa  627  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  54.53 
 
 		 732 aa  622  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  52.78 
 
 		 822 aa  621  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  51.62 
 
 		 1161 aa  618  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  55.33 
 
 		 949 aa  616  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  52.81 
 
 		 686 aa  612  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  55.81 
 
 		 1035 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  49.85 
 
 		 922 aa  609  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  44.5 
 
 		 947 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  53.82 
 
 		 964 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  53.82 
 
 		 964 aa  602  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  49.61 
 
 		 673 aa  599  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 		 679 aa  598  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 		 679 aa  598  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  45.55 
 
 		 882 aa  600  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  51.15 
 
 		 997 aa  597  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  50.69 
 
 		 989 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  53.16 
 
 		 979 aa  597  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2295  translation initiation factor IF-2  49.43 
 
 		 886 aa  592  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0792369 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  49.48 
 
 		 976 aa  592  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  50.54 
 
 		 986 aa  593  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  50.07 
 
 		 971 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  51.33 
 
 		 853 aa  592  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  50.07 
 
 		 971 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  50.85 
 
 		 971 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  50.07 
 
 		 971 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  51.31 
 
 		 965 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  50.85 
 
 		 972 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  53.16 
 
 		 964 aa  588  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  52.09 
 
 		 875 aa  589  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  52.09 
 
 		 875 aa  589  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  46.96 
 
 		 892 aa  592  1e-167  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  49.55 
 
 		 975 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  49.55 
 
 		 975 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  49.78 
 
 		 972 aa  586  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  49.55 
 
 		 975 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  50.54 
 
 		 969 aa  586  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  49.55 
 
 		 975 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  49.4 
 
 		 975 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0983  translation initiation factor IF-2  51.61 
 
 		 593 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  50.57 
 
 		 686 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  49.4 
 
 		 975 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  52.3 
 
 		 689 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  53.46 
 
 		 924 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  49.4 
 
 		 975 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  50.68 
 
 		 907 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  50.92 
 
 		 688 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  51.72 
 
 		 962 aa  583  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  50.57 
 
 		 686 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  47.18 
 
 		 945 aa  581  1e-164  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  52.23 
 
 		 688 aa  579  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_855  translation initiation factor 2 (IF-2)  50.41 
 
 		 593 aa  582  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00962289  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  50.57 
 
 		 686 aa  580  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  50.57 
 
 		 686 aa  580  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  52.5 
 
 		 1005 aa  582  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  52.49 
 
 		 686 aa  580  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  50.5 
 
 		 1079 aa  579  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  51.88 
 
 		 720 aa  578  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  52.36 
 
 		 894 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 686 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0874  translation initiation factor IF-2  49.34 
 
 		 593 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0133057  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  51.99 
 
 		 966 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  47.44 
 
 		 984 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 686 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  52.23 
 
 		 1131 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  49.07 
 
 		 949 aa  577  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  52.73 
 
 		 898 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  51.42 
 
 		 904 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  51.08 
 
 		 896 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  50.66 
 
 		 896 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  47.88 
 
 		 885 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  50.84 
 
 		 984 aa  571  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  48.38 
 
 		 943 aa  568  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  50.66 
 
 		 876 aa  572  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  45.98 
 
 		 873 aa  572  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4217  translation initiation factor 2  48.42 
 
 		 1011 aa  570  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726068  normal  0.0540264 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  46.95 
 
 		 964 aa  569  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  51.6 
 
 		 856 aa  569  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  50.16 
 
 		 959 aa  565  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  50 
 
 		 843 aa  566  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  51.18 
 
 		 891 aa  567  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>