More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1093 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  48.7 
 
 		 890 aa  758    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  48.7 
 
 		 890 aa  758    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  54.07 
 
 		 883 aa  643    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4712  translation initiation factor IF-2  61.07 
 
 		 846 aa  739    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333126  normal  0.0123461 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3596  translation initiation factor IF-2  49.19 
 
 		 892 aa  767    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000160504  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4712  translation initiation factor IF-2  62.58 
 
 		 842 aa  738    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.940521  normal  0.658182 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3603  translation initiation factor IF-2  48.81 
 
 		 890 aa  759    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1315  translation initiation factor IF-2  61.05 
 
 		 868 aa  722    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  72.13 
 
 		 964 aa  999    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  46.07 
 
 		 905 aa  719    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  57.89 
 
 		 889 aa  722    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1749  translation initiation factor IF-2  59.26 
 
 		 890 aa  704    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0133551  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  62.24 
 
 		 885 aa  773    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0530  translation initiation factor IF-2  48.7 
 
 		 890 aa  758    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  decreased coverage  0.0000498988 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  59.63 
 
 		 885 aa  768    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4490  translation initiation factor IF-2  63.09 
 
 		 841 aa  739    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0593821  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3464  translation initiation factor IF-2  48.7 
 
 		 890 aa  758    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345648 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4577  translation initiation factor IF-2  61.07 
 
 		 846 aa  739    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  48.7 
 
 		 890 aa  758    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  75.61 
 
 		 975 aa  995    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  60.36 
 
 		 868 aa  743    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  60.36 
 
 		 868 aa  743    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4180  translation initiation factor IF-2  63.26 
 
 		 841 aa  742    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  44.86 
 
 		 908 aa  734    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  61.28 
 
 		 904 aa  1017    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  75.61 
 
 		 975 aa  995    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01303  translation initiation factor IF-2  55.89 
 
 		 904 aa  695    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273892  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  72.4 
 
 		 966 aa  977    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  66.86 
 
 		 922 aa  892    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  48.58 
 
 		 894 aa  773    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  75.77 
 
 		 975 aa  997    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  50.83 
 
 		 845 aa  780    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0779  translation initiation factor IF-2  61 
 
 		 837 aa  740    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679376  normal  0.0113763 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  73.4 
 
 		 986 aa  991    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  53.3 
 
 		 947 aa  645    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  72.75 
 
 		 972 aa  1000    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  72.14 
 
 		 964 aa  1014    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  59.65 
 
 		 894 aa  762    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0203  translation initiation factor IF-2  45.23 
 
 		 892 aa  724    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.665385  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  59.56 
 
 		 848 aa  709    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  72.79 
 
 		 971 aa  1002    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1123  translation initiation factor IF-2  57.67 
 
 		 818 aa  684    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  47.54 
 
 		 854 aa  752    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3993  translation initiation factor IF-2  49.4 
 
 		 884 aa  774    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  57.64 
 
 		 876 aa  960    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3730  translation initiation factor IF-2  49.19 
 
 		 892 aa  767    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187768  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  71.77 
 
 		 976 aa  999    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  90.54 
 
 		 920 aa  1521    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0563  translation initiation factor IF-2  62.62 
 
 		 816 aa  744    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.852622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5462  translation initiation factor IF-2  62.9 
 
 		 837 aa  736    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  56.91 
 
 		 953 aa  962    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2134  translation initiation factor IF-2  58.82 
 
 		 978 aa  976    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149988  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2708  translation initiation factor IF-2  60.17 
 
 		 908 aa  688    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.334172  normal  0.377403 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  59.47 
 
 		 896 aa  758    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  58.66 
 
 		 907 aa  993    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  68.46 
 
 		 968 aa  931    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  73.69 
 
 		 989 aa  993    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  48.7 
 
 		 890 aa  758    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  60.27 
 
 		 843 aa  720    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1093  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 917 aa  1816    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  45.11 
 
 		 908 aa  734    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  72.01 
 
 		 979 aa  1027    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0631  translation initiation factor IF2-2  43.37 
 
 		 880 aa  690    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  75.61 
 
 		 975 aa  995    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  52.66 
 
 		 835 aa  641    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3605  translation initiation factor IF-2  48.3 
 
 		 898 aa  766    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600034  normal  0.0461803 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  72.79 
 
 		 971 aa  1002    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  61.76 
 
 		 898 aa  723    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  60.29 
 
 		 869 aa  731    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0721  translation initiation factor IF-2  62.92 
 
 		 843 aa  738    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.467302  normal  0.0872602 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  73.26 
 
 		 969 aa  1002    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  66.47 
 
 		 991 aa  892    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  54.59 
 
 		 882 aa  638    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  58.87 
 
 		 885 aa  765    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  58.87 
 
 		 885 aa  765    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  58.31 
 
 		 883 aa  720    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  57.98 
 
 		 881 aa  754    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  61.42 
 
 		 896 aa  754    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1600  translation initiation factor IF-2  62.62 
 
 		 803 aa  744    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0215539  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  72.61 
 
 		 971 aa  1000    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62760  translation initiation factor IF-2  62.9 
 
 		 840 aa  737    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0503522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  58.04 
 
 		 943 aa  987    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  58.22 
 
 		 943 aa  1005    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  75.61 
 
 		 975 aa  995    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  75.77 
 
 		 975 aa  998    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3608  translation initiation factor IF-2  61.2 
 
 		 828 aa  737    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  75.77 
 
 		 975 aa  997    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  72.79 
 
 		 971 aa  1002    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  74.77 
 
 		 972 aa  988    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  54.5 
 
 		 949 aa  640    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  59.48 
 
 		 889 aa  766    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  60.55 
 
 		 880 aa  758    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  66.49 
 
 		 948 aa  946    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0179  translation initiation factor IF-2  45.12 
 
 		 892 aa  724    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.61877  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  49.14 
 
 		 895 aa  775    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  70.95 
 
 		 965 aa  998    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2749  translation initiation factor IF-2  64.56 
 
 		 990 aa  860    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.867679  normal  0.130193 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  59.15 
 
 		 882 aa  764    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  48.91 
 
 		 880 aa  779    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  67.27 
 
 		 992 aa  930    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>