More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2594 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0179  translation initiation factor IF-2  44.25 
 
 		 892 aa  637    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.61877  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  55.59 
 
 		 965 aa  651    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  55.05 
 
 		 883 aa  660    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1093  translation initiation factor IF-2  54.1 
 
 		 917 aa  637    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  53.55 
 
 		 972 aa  641    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  65.42 
 
 		 885 aa  819    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  64.58 
 
 		 887 aa  836    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  51.12 
 
 		 880 aa  651    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0033  translation initiation factor IF-2  56.69 
 
 		 1045 aa  721    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  55.42 
 
 		 964 aa  638    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3563  translation initiation factor IF-2  82.54 
 
 		 832 aa  1081    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2611  translation initiation factor IF-2  60.94 
 
 		 981 aa  741    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.709252  normal  0.107051 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  54.43 
 
 		 975 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  85.13 
 
 		 836 aa  1080    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  57.49 
 
 		 959 aa  837    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  51.87 
 
 		 885 aa  659    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  57.09 
 
 		 964 aa  849    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  56.03 
 
 		 990 aa  809    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  60.3 
 
 		 921 aa  773    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3816  translation initiation factor IF-2  58.59 
 
 		 856 aa  741    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134229  normal  0.0174936 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  54.43 
 
 		 975 aa  649    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  55.04 
 
 		 868 aa  641    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  55.21 
 
 		 868 aa  641    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  47.71 
 
 		 894 aa  656    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3727  translation initiation factor IF-2  61.83 
 
 		 971 aa  762    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.057525 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  48.53 
 
 		 904 aa  650    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  54.07 
 
 		 848 aa  838    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  52.32 
 
 		 882 aa  666    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  55.25 
 
 		 966 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0203  translation initiation factor IF-2  44.25 
 
 		 892 aa  638    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.665385  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  49.72 
 
 		 922 aa  654    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0024  translation initiation factor IF-2  61.65 
 
 		 871 aa  761    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  54.27 
 
 		 975 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  55.44 
 
 		 986 aa  646    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  84.98 
 
 		 836 aa  1079    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1047  translation initiation factor IF-2  60.84 
 
 		 1053 aa  734    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  55.52 
 
 		 972 aa  636    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  56.3 
 
 		 898 aa  645    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  54.27 
 
 		 975 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  55.31 
 
 		 884 aa  647    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0293  translation initiation factor IF-2  62.4 
 
 		 1083 aa  782    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00928073 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  46.05 
 
 		 854 aa  639    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2819  translation initiation factor IF-2  60.75 
 
 		 990 aa  749    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  51.12 
 
 		 880 aa  651    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  56.03 
 
 		 943 aa  637    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  55.76 
 
 		 876 aa  646    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  57.41 
 
 		 873 aa  757    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01303  translation initiation factor IF-2  55.8 
 
 		 904 aa  647    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273892  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  54.27 
 
 		 976 aa  645    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  51.12 
 
 		 880 aa  651    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  61.36 
 
 		 886 aa  758    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2490  translation initiation factor IF-2  58.37 
 
 		 875 aa  724    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  55.69 
 
 		 992 aa  648    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0038  translation initiation factor IF-2  75.5 
 
 		 824 aa  1132    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  55.31 
 
 		 986 aa  649    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0440  translation initiation factor IF-2  61.73 
 
 		 883 aa  761    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  60.47 
 
 		 880 aa  756    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  46.5 
 
 		 907 aa  684    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  55.86 
 
 		 968 aa  640    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  55.61 
 
 		 989 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  50.97 
 
 		 884 aa  649    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  51.84 
 
 		 883 aa  768    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  54.27 
 
 		 843 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0031  translation initiation factor IF-2  61.75 
 
 		 868 aa  761    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2697  translation initiation factor IF-2  61.54 
 
 		 989 aa  754    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  55.25 
 
 		 979 aa  656    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  51.87 
 
 		 880 aa  655    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  54.75 
 
 		 948 aa  640    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  77.27 
 
 		 835 aa  1165    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0612  translation initiation factor IF-2  58.84 
 
 		 845 aa  728    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0968574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  55.52 
 
 		 971 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  54.43 
 
 		 975 aa  649    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  47.76 
 
 		 895 aa  641    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  65.57 
 
 		 856 aa  810    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  54.62 
 
 		 882 aa  637    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  55.44 
 
 		 920 aa  651    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  55.52 
 
 		 971 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  49 
 
 		 831 aa  646    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  53.94 
 
 		 880 aa  637    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  52.02 
 
 		 885 aa  660    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  52.02 
 
 		 885 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  55.3 
 
 		 883 aa  646    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  49.79 
 
 		 881 aa  667    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  61.2 
 
 		 887 aa  744    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3043  translation initiation factor IF-2  60.5 
 
 		 861 aa  783    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  53.55 
 
 		 971 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  54.19 
 
 		 969 aa  645    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  53.62 
 
 		 848 aa  643    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  54.27 
 
 		 975 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  84.67 
 
 		 838 aa  1075    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  54.38 
 
 		 885 aa  647    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  54.43 
 
 		 975 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  55.52 
 
 		 971 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  56.22 
 
 		 949 aa  658    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  49.93 
 
 		 889 aa  663    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  54.37 
 
 		 894 aa  637    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1749  translation initiation factor IF-2  56.14 
 
 		 890 aa  641    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0133551  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  54.97 
 
 		 921 aa  638    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  48.55 
 
 		 896 aa  641    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 848 aa  1683    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>