18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0653 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0653  antigen 34 kDa family protein  100 
 
 		 309 aa  567  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5978  hypothetical protein  44.4 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128515  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3259  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  38.19 
 
 		 830 aa  56.2  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  33.14 
 
 		 1029 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  49.62 
 
 		 514 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00420  FHA domain-containing protein  45.6 
 
 		 406 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.295501 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0153  hypothetical protein  42.66 
 
 		 784 aa  49.3  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4754  hypothetical protein  31.94 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1443  peptidase domain protein  55.26 
 
 		 442 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15396  predicted protein  38.89 
 
 		 1803 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.407971  normal  0.0726327 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1119  G5 domain protein  30 
 
 		 1859 aa  46.2  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  42.31 
 
 		 1079 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5862  hypothetical protein  38.21 
 
 		 438 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310924  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  28.24 
 
 		 2851 aa  43.5  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4817  hypothetical protein  35.88 
 
 		 267 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.249898  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01390  heterokaryon incompatibility protein HET-C, putative  37.5 
 
 		 789 aa  43.1  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.323382  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  30.89 
 
 		 2272 aa  42.7  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04670  conserved hypothetical protein  27.45 
 
 		 2094 aa  42.7  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>