40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1119 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1119  G5 domain protein  100 
 
 
1859 aa  3660    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  28.14 
 
 
2397 aa  133  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8097  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain-like protein  49.46 
 
 
521 aa  117  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  31.58 
 
 
2449 aa  92.8  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  42.06 
 
 
3521 aa  80.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  34.8 
 
 
3409 aa  72.8  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  40.95 
 
 
751 aa  68.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  39.55 
 
 
3471 aa  66.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  39.09 
 
 
3472 aa  65.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0409  hypothetical protein  28.08 
 
 
527 aa  64.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282348  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2521  cell wall anchor domain-containing protein  27.16 
 
 
987 aa  64.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2573  cell wall anchor domain-containing protein  27.16 
 
 
987 aa  64.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0854  hypothetical protein  25.77 
 
 
500 aa  63.2  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.939833 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  53.93 
 
 
2179 aa  62.4  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  38.26 
 
 
1049 aa  60.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  52 
 
 
2272 aa  59.7  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  35.5 
 
 
1888 aa  59.3  0.0000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  33.61 
 
 
344 aa  55.8  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  36.23 
 
 
445 aa  55.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2923  cell wall surface anchor family protein  45.9 
 
 
746 aa  54.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5097  hypothetical protein  30.05 
 
 
537 aa  53.5  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00280261  normal  0.375378 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0962  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  45.32 
 
 
971 aa  52.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  47.48 
 
 
1328 aa  52.4  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0828  cell wall anchor domain-containing protein  45.59 
 
 
969 aa  52.4  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0871  cell wall anchor domain-containing protein  45.59 
 
 
969 aa  52.4  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0776  collagen-binding surface protein  46.21 
 
 
913 aa  52.4  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133047  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3080  Extensin family protein  34.91 
 
 
316 aa  50.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0739  YSIRK Gram-positive signal peptide  29.84 
 
 
2035 aa  50.8  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  39.44 
 
 
340 aa  48.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2205  peptidase M23B  36 
 
 
450 aa  47.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000218447  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  34.21 
 
 
648 aa  47.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9256  hypothetical protein  25.4 
 
 
380 aa  48.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  33.1 
 
 
767 aa  47  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0535  3D domain protein  33.33 
 
 
342 aa  47.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2870  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.71 
 
 
498 aa  47  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00175644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  53.16 
 
 
2136 aa  46.6  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2032  ribonuclease  30.56 
 
 
1142 aa  45.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.390229  normal  0.144876 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  26.76 
 
 
238 aa  45.8  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1891  hypothetical protein  28.68 
 
 
295 aa  45.4  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1415  hypothetical protein  25.41 
 
 
604 aa  45.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.119038 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>