122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0286 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  467  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0136  Sporulation domain protein  79.51 
 
 		 236 aa  324  6e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  80.33 
 
 		 236 aa  323  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  61 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  49.62 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  40.99 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  39.03 
 
 		 274 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  41.79 
 
 		 265 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0085  sporulation repeat-containing protein  38.25 
 
 		 282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0591  sporulation repeat-containing protein  38.25 
 
 		 282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.809015  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3098  sporulation repeat-containing protein  38.25 
 
 		 282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1998  sporulation repeat-containing protein  38.25 
 
 		 282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787505  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0429  cell division protein  38.25 
 
 		 286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2290  sporulation repeat-containing protein  38.25 
 
 		 282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2306  sporulation related  36 
 
 		 297 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2920  sporulation domain-containing protein  36 
 
 		 297 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417345  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2935  sporulation domain-containing protein  35.88 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  35.09 
 
 		 211 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0415  sporulation domain-containing protein  34.38 
 
 		 218 aa  123  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0333  Sporulation domain protein  34.75 
 
 		 208 aa  122  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0344  sporulation domain-containing protein  35.86 
 
 		 208 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.777067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  37.65 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4489  sporulation related  34.91 
 
 		 206 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0462  Sporulation domain protein  32.55 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26415  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0574  sporulation domain-containing protein  32.17 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3702  sporulation domain-containing protein  31.67 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0409  cell division protein  52.5 
 
 		 286 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0354  sporulation repeat-containing protein  52.56 
 
 		 282 aa  98.6  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0384  sporulation domain-containing protein  51.22 
 
 		 292 aa  98.6  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.548534  normal  0.309068 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2969  sporulation domain-containing protein  51.22 
 
 		 295 aa  98.6  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2832  sporulation domain-containing protein  51.22 
 
 		 301 aa  98.6  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6263  cell division protein  51.22 
 
 		 301 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1976  sporulation domain-containing protein  30.08 
 
 		 204 aa  96.3  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3865  sporulation related  30.96 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  35.29 
 
 		 210 aa  89  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  36.36 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4229  sporulation domain-containing protein  33.91 
 
 		 213 aa  72  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156013 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  26.85 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0262  hypothetical protein  33.65 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  25.43 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  38.89 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  24.57 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2773  sporulation domain-containing protein  36.99 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  30.28 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0819  sporulation domain-containing protein  43.55 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0831164  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2113  Sporulation domain protein  33.82 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4428  sporulation domain-containing protein  32.11 
 
 		 190 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66760  hypothetical protein  31.17 
 
 		 231 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0026  hypothetical protein  29.73 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5789  hypothetical protein  31.17 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0721  Sporulation domain protein  33.33 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5090  sporulation domain protein  29.87 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.153909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  28.57 
 
 		 352 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4963  sporulation domain-containing protein  29.87 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5140  sporulation domain-containing protein  29.87 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0910008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  26.98 
 
 		 281 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00725  hypothetical protein  37.33 
 
 		 183 aa  49.7  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  26.98 
 
 		 281 aa  49.7  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  26.98 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001747  cell division protein  35.06 
 
 		 144 aa  49.3  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0246  Sporulation domain protein  29.58 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.202943 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3090  hypothetical protein  30.99 
 
 		 213 aa  48.9  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0401965  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1119  G5 domain protein  26.76 
 
 		 1859 aa  48.5  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2741  putative cell division protein FtsN  35.21 
 
 		 189 aa  48.5  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2696  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  36 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193267  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0705  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 		 372 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2415  sporulation domain-containing protein  26.67 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799064  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0199  sporulation related  30.56 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.499859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0396  sporulation related  28.57 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0398  sporulation-like  25.79 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  33.57 
 
 		 2272 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  27.74 
 
 		 2449 aa  47  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2249  putative cell division protein FtsN  32.53 
 
 		 183 aa  47  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1686  sporulation domain-containing protein  32.88 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5139  hypothetical protein  28.57 
 
 		 231 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3763  sporulation domain-containing protein  29.49 
 
 		 199 aa  46.6  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.007756  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 		 210 aa  46.6  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0532  sporulation domain-containing protein  29.91 
 
 		 188 aa  46.2  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00323787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0375  sporulation domain-containing protein  26.67 
 
 		 232 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2238  hypothetical protein  31.51 
 
 		 263 aa  46.2  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.460395 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  32.38 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0549  sporulation domain-containing protein  29.52 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.45608  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0295  sporulation domain-containing protein  28.95 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  38.89 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4493  essential cell division protein FtsN  29.93 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4124  cell division protein FtsN, putative  27.06 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  40.32 
 
 		 2179 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2783  putative FtsN cell division protein  30.21 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.892232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4190  sporulation related  33.33 
 
 		 176 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3497  sporulation domain-containing protein  29.29 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0455  sporulation domain-containing protein  29.29 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0442  sporulation related  29.58 
 
 		 185 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4425  essential cell division protein FtsN  29.93 
 
 		 325 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45370  cell division protein FtsN  29.73 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4339  essential cell division protein FtsN  29.93 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0889614  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3780  sporulation domain-containing protein  32.91 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287293  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  27.4 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4309  essential cell division protein FtsN  29.93 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4423  essential cell division protein FtsN  29.93 
 
 		 328 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  27.22 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0365058 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>