124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2969 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_2969  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
295 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2832  sporulation domain-containing protein  97.34 
 
 
301 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2935  sporulation domain-containing protein  92.98 
 
 
298 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2306  sporulation related  91.97 
 
 
297 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2920  sporulation domain-containing protein  91.97 
 
 
297 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417345  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6263  cell division protein  88.82 
 
 
301 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0384  sporulation domain-containing protein  81.94 
 
 
292 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.548534  normal  0.309068 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0354  sporulation repeat-containing protein  74.16 
 
 
282 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0085  sporulation repeat-containing protein  73.31 
 
 
282 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0591  sporulation repeat-containing protein  73.31 
 
 
282 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.809015  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3098  sporulation repeat-containing protein  73.31 
 
 
282 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1998  sporulation repeat-containing protein  73.31 
 
 
282 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787505  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0429  cell division protein  73.31 
 
 
286 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2290  sporulation repeat-containing protein  73.31 
 
 
282 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0409  cell division protein  73.31 
 
 
286 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  63.67 
 
 
265 aa  331  8e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  64.12 
 
 
274 aa  329  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  64.78 
 
 
265 aa  326  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  57.32 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  39.11 
 
 
246 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  55 
 
 
236 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0136  Sporulation domain protein  55 
 
 
236 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  45.45 
 
 
238 aa  98.2  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  53.33 
 
 
211 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  48.61 
 
 
229 aa  86.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0333  Sporulation domain protein  48 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68871  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0415  sporulation domain-containing protein  48.61 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0344  sporulation domain-containing protein  50 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.777067  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  35 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0574  sporulation domain-containing protein  40 
 
 
225 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0462  Sporulation domain protein  41.33 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26415  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4489  sporulation related  48 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3702  sporulation domain-containing protein  46.67 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  39.24 
 
 
202 aa  71.6  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02917  hypothetical protein  37.33 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  45.45 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4229  sporulation domain-containing protein  37.38 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156013 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1976  sporulation domain-containing protein  38.67 
 
 
204 aa  68.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2113  Sporulation domain protein  38.2 
 
 
194 aa  68.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3865  sporulation related  38.03 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0721  Sporulation domain protein  41.86 
 
 
222 aa  65.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  34.67 
 
 
303 aa  62.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  31.08 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  31.08 
 
 
248 aa  60.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0398  sporulation-like  33.96 
 
 
238 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  39.73 
 
 
198 aa  60.1  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0819  sporulation domain-containing protein  36.36 
 
 
214 aa  60.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0831164  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5090  sporulation domain protein  36.84 
 
 
232 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.153909  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4963  sporulation domain-containing protein  36.84 
 
 
232 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5140  sporulation domain-containing protein  36.84 
 
 
232 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0910008  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3090  hypothetical protein  30.67 
 
 
213 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0401965  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2773  sporulation domain-containing protein  34.12 
 
 
222 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521305  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0396  sporulation related  36 
 
 
231 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0375  sporulation domain-containing protein  34.67 
 
 
232 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5139  hypothetical protein  36 
 
 
231 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001747  cell division protein  35.21 
 
 
144 aa  55.8  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45370  cell division protein FtsN  34.88 
 
 
264 aa  55.8  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0442  sporulation related  30.59 
 
 
185 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66760  hypothetical protein  30.1 
 
 
231 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4428  sporulation domain-containing protein  31.17 
 
 
190 aa  53.1  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3763  sporulation domain-containing protein  28 
 
 
199 aa  53.1  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.007756  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5789  hypothetical protein  30.1 
 
 
230 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2741  putative cell division protein FtsN  33.8 
 
 
189 aa  52  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0262  hypothetical protein  30.14 
 
 
202 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0246  Sporulation domain protein  30.49 
 
 
194 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.202943 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4190  sporulation related  30.67 
 
 
176 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00725  hypothetical protein  32.39 
 
 
183 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3780  sporulation domain-containing protein  32 
 
 
191 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287293  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4425  essential cell division protein FtsN  34.58 
 
 
325 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3497  sporulation domain-containing protein  31.34 
 
 
231 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0455  sporulation domain-containing protein  31.34 
 
 
231 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3674  sporulation domain-containing protein  31.34 
 
 
231 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4493  essential cell division protein FtsN  34.58 
 
 
324 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4309  essential cell division protein FtsN  34.58 
 
 
334 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4339  essential cell division protein FtsN  34.58 
 
 
324 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0889614  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0494  sporulation domain-containing protein  32.1 
 
 
238 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4423  essential cell division protein FtsN  34.58 
 
 
328 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4124  cell division protein FtsN, putative  31.34 
 
 
231 aa  50.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0199  sporulation related  34.72 
 
 
228 aa  50.4  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.499859  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3846  sporulation domain-containing protein  32.88 
 
 
238 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0549  sporulation domain-containing protein  30.99 
 
 
230 aa  50.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.45608  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0473  sporulation domain-containing protein  32.88 
 
 
238 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0497  Sporulation domain protein  32.88 
 
 
238 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0532  sporulation domain-containing protein  31.17 
 
 
188 aa  49.7  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00323787  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03518  Sporulation related  28.77 
 
 
192 aa  49.7  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.775864  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5390  essential cell division protein FtsN  32.32 
 
 
319 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.653207  normal  0.982953 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2415  sporulation domain-containing protein  32.88 
 
 
213 aa  49.3  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799064  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2696  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  34.95 
 
 
186 aa  48.9  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193267  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0026  hypothetical protein  25.96 
 
 
201 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3796  cell division protein FtsN  24.65 
 
 
280 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4791  cell division protein FtsN  28.28 
 
 
312 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000221043 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0377  sporulation domain-containing protein  29.33 
 
 
192 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03818  essential cell division protein  32.14 
 
 
319 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4052  cell division protein FtsN  32.14 
 
 
284 aa  47  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2783  putative FtsN cell division protein  33.78 
 
 
176 aa  47  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.892232 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0705  sporulation domain-containing protein  32.53 
 
 
372 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4165  essential cell division protein FtsN  32.14 
 
 
319 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4469  essential cell division protein FtsN  32.14 
 
 
319 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4085  cell division protein FtsN  32.14 
 
 
284 aa  47  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4375  essential cell division protein FtsN  32.14 
 
 
319 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.909645 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>