122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4190 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4190  sporulation related  100 
 
 		 176 aa  362  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0377  sporulation domain-containing protein  48.68 
 
 		 192 aa  175  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03518  Sporulation related  54.36 
 
 		 192 aa  168  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.775864  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3763  sporulation domain-containing protein  46.77 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.007756  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0442  sporulation related  49.71 
 
 		 185 aa  157  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0532  sporulation domain-containing protein  47.87 
 
 		 188 aa  155  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00323787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3358  sporulation related  46.15 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3780  sporulation domain-containing protein  46.6 
 
 		 191 aa  155  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287293  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4428  sporulation domain-containing protein  45.21 
 
 		 190 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2741  putative cell division protein FtsN  42.86 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0005  cell division protein FtsN  46.1 
 
 		 177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00725  hypothetical protein  44.62 
 
 		 183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0549  sporulation domain-containing protein  37.33 
 
 		 230 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.45608  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3497  sporulation domain-containing protein  40.53 
 
 		 231 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0455  sporulation domain-containing protein  40.53 
 
 		 231 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4124  cell division protein FtsN, putative  40.21 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3674  sporulation domain-containing protein  40 
 
 		 231 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4367  putative cell division protein FtsN  46.31 
 
 		 191 aa  128  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0497  Sporulation domain protein  40.41 
 
 		 238 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3846  sporulation domain-containing protein  40.41 
 
 		 238 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0494  sporulation domain-containing protein  38.86 
 
 		 238 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2249  putative cell division protein FtsN  41.44 
 
 		 183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0473  sporulation domain-containing protein  40.41 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001747  cell division protein  44.76 
 
 		 144 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  41.25 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  41.25 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  41.25 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4791  cell division protein FtsN  37.27 
 
 		 312 aa  67  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000221043 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  30.19 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2012  hypothetical protein  37.14 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2007  hypothetical protein  37.14 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3796  cell division protein FtsN  37.5 
 
 		 280 aa  61.6  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4040  essential cell division protein FtsN  40.85 
 
 		 344 aa  60.8  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0819  sporulation domain-containing protein  30.72 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0831164  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4052  cell division protein FtsN  40.85 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5390  essential cell division protein FtsN  40.85 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.653207  normal  0.982953 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4469  essential cell division protein FtsN  40.85 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4085  cell division protein FtsN  40.85 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4375  essential cell division protein FtsN  40.85 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.909645 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4415  essential cell division protein FtsN  40.85 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0743452  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03818  essential cell division protein  40.85 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03767  hypothetical protein  40.85 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4165  essential cell division protein FtsN  40.85 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4493  essential cell division protein FtsN  36.11 
 
 		 324 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4423  essential cell division protein FtsN  36.11 
 
 		 328 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4425  essential cell division protein FtsN  36.11 
 
 		 325 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4309  essential cell division protein FtsN  36.11 
 
 		 334 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4339  essential cell division protein FtsN  36.11 
 
 		 324 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0889614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0167  cell division protein FtsN  29.09 
 
 		 257 aa  57.8  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0181  cell division protein FtsN  28.18 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  36.59 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0246  Sporulation domain protein  25.27 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.202943 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1124  cell division protein FtsN  27.42 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.1824  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0262  hypothetical protein  25.98 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2783  putative FtsN cell division protein  31.31 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.892232 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  32.11 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  35.37 
 
 		 246 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  35.44 
 
 		 265 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02917  hypothetical protein  44.78 
 
 		 293 aa  52.8  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2969  sporulation domain-containing protein  30.67 
 
 		 295 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4127  sporulation domain-containing protein  26.59 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187687  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  32 
 
 		 274 aa  52  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6263  cell division protein  30.67 
 
 		 301 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2696  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  38.71 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193267  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2306  sporulation related  30.67 
 
 		 297 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2113  Sporulation domain protein  38.57 
 
 		 194 aa  51.6  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2920  sporulation domain-containing protein  30.67 
 
 		 297 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2832  sporulation domain-containing protein  30.67 
 
 		 301 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  32 
 
 		 265 aa  51.6  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2935  sporulation domain-containing protein  30.67 
 
 		 298 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  32.89 
 
 		 239 aa  50.8  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0085  sporulation repeat-containing protein  31.17 
 
 		 282 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0396  sporulation related  25.49 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0591  sporulation repeat-containing protein  31.17 
 
 		 282 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.809015  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0354  sporulation repeat-containing protein  31.17 
 
 		 282 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3098  sporulation repeat-containing protein  31.17 
 
 		 282 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1998  sporulation repeat-containing protein  31.17 
 
 		 282 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787505  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0409  cell division protein  31.17 
 
 		 286 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2290  sporulation repeat-containing protein  31.17 
 
 		 282 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  37.5 
 
 		 248 aa  50.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5090  sporulation domain protein  23.67 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.153909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0026  hypothetical protein  26.98 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0429  cell division protein  31.17 
 
 		 286 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4963  sporulation domain-containing protein  23.67 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0384  sporulation domain-containing protein  29.33 
 
 		 292 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.548534  normal  0.309068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  32.93 
 
 		 236 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66760  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2415  sporulation domain-containing protein  34.29 
 
 		 213 aa  48.9  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799064  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5789  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5140  sporulation domain-containing protein  35.71 
 
 		 232 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0910008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  38.33 
 
 		 248 aa  49.3  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45370  cell division protein FtsN  30.49 
 
 		 264 aa  48.9  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  36.36 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0375  sporulation domain-containing protein  38.46 
 
 		 232 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0136  Sporulation domain protein  32.93 
 
 		 236 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5139  hypothetical protein  33.85 
 
 		 231 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0924  sporulation domain-containing protein  31.71 
 
 		 709 aa  47.4  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.993892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  30 
 
 		 229 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  34.29 
 
 		 202 aa  47  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0574  sporulation domain-containing protein  30.34 
 
 		 225 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>