29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0924 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0924  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
709 aa  1426    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.993892  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0923  sporulation domain-containing protein  32.39 
 
 
555 aa  69.7  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3711  serine/threonine protein kinase  22.7 
 
 
1143 aa  67.8  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  38.1 
 
 
194 aa  60.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  40.58 
 
 
271 aa  54.7  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0262  sporulation domain-containing protein  27.54 
 
 
265 aa  53.9  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.677287  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  37.31 
 
 
345 aa  52  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  39.66 
 
 
280 aa  50.8  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  33.8 
 
 
223 aa  50.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  37.93 
 
 
280 aa  49.7  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  40.62 
 
 
255 aa  49.3  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  36.76 
 
 
210 aa  48.9  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1025  hypothetical protein  24.88 
 
 
328 aa  48.5  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.469684  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2035  sporulation domain-containing protein  28.57 
 
 
533 aa  47.8  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.524131 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  37.1 
 
 
313 aa  47.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  35.48 
 
 
290 aa  47  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1240  sporulation domain-containing protein  36.11 
 
 
228 aa  47  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.873348 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0901  sporulation domain-containing protein  24.88 
 
 
328 aa  47.4  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3328  sporulation domain-containing protein  36.23 
 
 
263 aa  46.6  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  32.2 
 
 
248 aa  46.2  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4190  sporulation related  34.15 
 
 
176 aa  46.2  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  37.93 
 
 
315 aa  45.8  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  37.5 
 
 
218 aa  45.8  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3090  hypothetical protein  31.58 
 
 
213 aa  45.4  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0401965  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  35.21 
 
 
268 aa  45.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  31.75 
 
 
254 aa  45.4  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0395  Sporulation domain-containing protein  26.67 
 
 
144 aa  45.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000168125  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  37.1 
 
 
332 aa  44.7  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0375  sporulation domain-containing protein  30.43 
 
 
232 aa  44.3  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>