23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2035 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2035  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
533 aa  1020    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.524131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3167  sporulation related  31.91 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.085105  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  34.35 
 
 
215 aa  65.1  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  36 
 
 
280 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  36 
 
 
280 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  36.99 
 
 
315 aa  60.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  29.5 
 
 
332 aa  60.1  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  34.62 
 
 
290 aa  57.4  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  35.62 
 
 
255 aa  55.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  34.72 
 
 
268 aa  55.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  34.88 
 
 
239 aa  51.2  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1686  sporulation domain-containing protein  35.82 
 
 
249 aa  51.2  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  38.24 
 
 
345 aa  50.4  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  30.99 
 
 
228 aa  48.9  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0901  sporulation domain-containing protein  31 
 
 
328 aa  49.3  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0924  sporulation domain-containing protein  28.57 
 
 
709 aa  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.993892  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1025  hypothetical protein  34.72 
 
 
328 aa  48.1  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.469684  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2685  sporulation related  30.56 
 
 
257 aa  47  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  34.23 
 
 
211 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  30.3 
 
 
254 aa  46.2  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3575  sporulation domain-containing protein  44 
 
 
462 aa  45.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409926  normal  0.380426 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  29.09 
 
 
245 aa  44.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  30.67 
 
 
279 aa  44.3  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>