116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2153 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  100 
 
 
268 aa  508  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  40.85 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  44.4 
 
 
255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  42.16 
 
 
313 aa  163  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  38.41 
 
 
315 aa  152  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2685  sporulation related  43.12 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  36.69 
 
 
332 aa  142  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  40.34 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  40 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  33.73 
 
 
239 aa  88.6  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  28.85 
 
 
215 aa  87.8  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1686  sporulation domain-containing protein  54.67 
 
 
249 aa  85.9  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  32.91 
 
 
228 aa  85.5  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  25.7 
 
 
245 aa  82.4  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  53.95 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  31.42 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  36.1 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  32.2 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1045  Sporulation domain protein  30.04 
 
 
268 aa  62  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.827032 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4379  sporulation domain-containing protein  30.42 
 
 
306 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772559  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  28.19 
 
 
224 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  27.75 
 
 
224 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  27.31 
 
 
224 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  30.58 
 
 
285 aa  58.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  30.16 
 
 
233 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  27.31 
 
 
224 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1808  Sporulation domain protein  32.17 
 
 
288 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  26.87 
 
 
224 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  28.1 
 
 
275 aa  57.4  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2132  Sporulation domain protein  31.14 
 
 
286 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664286  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  31.13 
 
 
210 aa  56.2  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  41.43 
 
 
345 aa  55.8  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1910  hypothetical protein  31.22 
 
 
214 aa  55.5  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.504476 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4404  sporulation related  42.65 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3963  sporulation domain-containing protein  42.65 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.832057 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3565  sporulation domain-containing protein  42.65 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  29.05 
 
 
240 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2035  sporulation domain-containing protein  34.72 
 
 
533 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.524131 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  29.05 
 
 
240 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2120  hypothetical protein  42.42 
 
 
281 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0535891 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3353  sporulation domain-containing protein  40.51 
 
 
285 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36909  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4617  sporulation domain-containing protein  53.19 
 
 
273 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.602598  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  28.46 
 
 
245 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  24.43 
 
 
203 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1716  sporulation repeat-containing protein  50 
 
 
241 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.448122  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1654  sporulation repeat-containing protein  50 
 
 
241 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1863  sporulation repeat-containing protein  50 
 
 
241 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2440  sporulation and cell division repeat-containing protein  50 
 
 
241 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.371782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0534  sporulation repeat-containing protein  50 
 
 
241 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2302  sporulation and cell division repeat-containing protein  50 
 
 
241 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3858  sporulation domain-containing protein  41.18 
 
 
282 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  37.14 
 
 
346 aa  52.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0764  sporulation repeat-containing protein  50 
 
 
271 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0684  sporulation repeat-containing protein  50 
 
 
271 aa  52.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233168  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  26.75 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  24.34 
 
 
205 aa  51.6  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  24.34 
 
 
203 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  24.19 
 
 
214 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  32.65 
 
 
279 aa  50.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  32.59 
 
 
210 aa  49.3  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  26.5 
 
 
218 aa  48.9  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  27.91 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  25.61 
 
 
177 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  28.05 
 
 
194 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  25.2 
 
 
246 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  26.47 
 
 
250 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3090  hypothetical protein  31.51 
 
 
213 aa  46.6  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0401965  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  27.88 
 
 
281 aa  46.2  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2794  sporulation domain-containing protein  37.1 
 
 
671 aa  46.2  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0534  sporulation domain-containing protein  27.5 
 
 
224 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  35.16 
 
 
333 aa  46.2  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2282  Sporulation domain protein  32.48 
 
 
256 aa  46.2  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.179411  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  26.14 
 
 
198 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2773  sporulation domain-containing protein  31.03 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521305  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0924  sporulation domain-containing protein  35.21 
 
 
709 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.993892  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45370  cell division protein FtsN  32.67 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  26.15 
 
 
206 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  25.68 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  24.28 
 
 
250 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  26.55 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  26.55 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  26.55 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1673  hypothetical protein  30.95 
 
 
168 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.559277  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  23.11 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  28.69 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  26.55 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  26.55 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4791  cell division protein FtsN  27.52 
 
 
312 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000221043 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  26.55 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  26.55 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  25.68 
 
 
248 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  26.55 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  25.66 
 
 
189 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  26.55 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  27.21 
 
 
260 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  28.79 
 
 
324 aa  43.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1025  hypothetical protein  35.62 
 
 
328 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.469684  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  27.27 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6837  Sporulation domain protein  45.61 
 
 
307 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  28.05 
 
 
274 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.212039 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>