118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0534 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0534  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 224 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0398  sporulation-like  64.85 
 
 		 238 aa  284  8e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5090  sporulation domain protein  68.1 
 
 		 232 aa  279  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.153909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4963  sporulation domain-containing protein  68.1 
 
 		 232 aa  279  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5140  sporulation domain-containing protein  68.1 
 
 		 232 aa  277  9e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0910008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0375  sporulation domain-containing protein  65.95 
 
 		 232 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0396  sporulation related  64.04 
 
 		 231 aa  256  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66760  hypothetical protein  58.4 
 
 		 231 aa  256  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5139  hypothetical protein  63.6 
 
 		 231 aa  246  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5789  hypothetical protein  58.05 
 
 		 230 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45370  cell division protein FtsN  57.3 
 
 		 264 aa  105  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2696  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  32.32 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193267  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0262  hypothetical protein  32.43 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2415  sporulation domain-containing protein  27.35 
 
 		 213 aa  88.6  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799064  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0601  sporulation related  31.67 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.141318  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0246  Sporulation domain protein  32.86 
 
 		 194 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.202943 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2773  sporulation domain-containing protein  38.27 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  25.81 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  32.78 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  26.45 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0026  hypothetical protein  28.37 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0819  sporulation domain-containing protein  31.18 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0831164  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02917  hypothetical protein  37.33 
 
 		 293 aa  65.1  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  26.35 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0497  Sporulation domain protein  27.4 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2012  hypothetical protein  32.67 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3674  sporulation domain-containing protein  27.8 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  30.67 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2007  hypothetical protein  32.67 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3497  sporulation domain-containing protein  27.8 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0455  sporulation domain-containing protein  27.8 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3846  sporulation domain-containing protein  25.89 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4127  sporulation domain-containing protein  25 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187687  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0473  sporulation domain-containing protein  27.56 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0333  Sporulation domain protein  36.99 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68871  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3796  cell division protein FtsN  28.89 
 
 		 280 aa  55.1  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0344  sporulation domain-containing protein  36.99 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.777067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0295  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0494  sporulation domain-containing protein  27.43 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  36.99 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3090  hypothetical protein  26.43 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0401965  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2783  putative FtsN cell division protein  37.84 
 
 		 176 aa  52.8  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.892232 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  26.71 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  34.29 
 
 		 279 aa  52.8  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0415  sporulation domain-containing protein  36.99 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2238  hypothetical protein  24.55 
 
 		 263 aa  52  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.460395 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3865  sporulation related  35.29 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  33.73 
 
 		 281 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4791  cell division protein FtsN  39.19 
 
 		 312 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000221043 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  33.73 
 
 		 281 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  33.73 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0181  cell division protein FtsN  26.97 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4229  sporulation domain-containing protein  33.7 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156013 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  31.94 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0354  sporulation repeat-containing protein  30.38 
 
 		 282 aa  49.7  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  28.12 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2113  Sporulation domain protein  27.92 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0442  sporulation related  24.06 
 
 		 185 aa  48.9  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0574  sporulation domain-containing protein  35.9 
 
 		 225 aa  48.5  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1945  hypothetical protein  20.51 
 
 		 259 aa  48.1  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.749075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  34.72 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  28.69 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0462  Sporulation domain protein  33.33 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26415  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4124  cell division protein FtsN, putative  26.11 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0085  sporulation repeat-containing protein  28.4 
 
 		 282 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0591  sporulation repeat-containing protein  28.4 
 
 		 282 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.809015  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6263  cell division protein  30.67 
 
 		 301 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2306  sporulation related  30.67 
 
 		 297 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2969  sporulation domain-containing protein  30.67 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2920  sporulation domain-containing protein  30.67 
 
 		 297 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417345  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3098  sporulation repeat-containing protein  28.4 
 
 		 282 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1998  sporulation repeat-containing protein  28.4 
 
 		 282 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787505  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2290  sporulation repeat-containing protein  28.4 
 
 		 282 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1976  sporulation domain-containing protein  25.12 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0384  sporulation domain-containing protein  30.67 
 
 		 292 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.548534  normal  0.309068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2935  sporulation domain-containing protein  30.67 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2832  sporulation domain-containing protein  30.67 
 
 		 301 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0409  cell division protein  28.4 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0429  cell division protein  28.75 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0167  cell division protein FtsN  29.27 
 
 		 257 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3702  sporulation domain-containing protein  38.98 
 
 		 289 aa  46.2  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  27.03 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4489  sporulation related  33.33 
 
 		 206 aa  46.2  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0377  sporulation domain-containing protein  23.85 
 
 		 192 aa  46.2  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  26.25 
 
 		 265 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3358  sporulation related  26.88 
 
 		 198 aa  45.1  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0549  sporulation domain-containing protein  24.88 
 
 		 230 aa  45.1  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.45608  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  30.95 
 
 		 311 aa  45.1  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4367  putative cell division protein FtsN  33.9 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0199  sporulation related  22.5 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.499859  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4190  sporulation related  31.34 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  37.65 
 
 		 295 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5390  essential cell division protein FtsN  28.57 
 
 		 319 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.653207  normal  0.982953 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4493  essential cell division protein FtsN  27.06 
 
 		 324 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  27.03 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0136  Sporulation domain protein  27.03 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4423  essential cell division protein FtsN  27.06 
 
 		 328 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4425  essential cell division protein FtsN  27.06 
 
 		 325 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4309  essential cell division protein FtsN  27.06 
 
 		 334 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4339  essential cell division protein FtsN  27.06 
 
 		 324 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0889614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>