136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0123 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  494  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  98.39 
 
 		 248 aa  485  1e-136  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02917  hypothetical protein  44.07 
 
 		 293 aa  198  7e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  62.82 
 
 		 303 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5140  sporulation domain-containing protein  30.77 
 
 		 232 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0910008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66760  hypothetical protein  28.69 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5090  sporulation domain protein  32.52 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.153909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4963  sporulation domain-containing protein  32.52 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0375  sporulation domain-containing protein  30.36 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2773  sporulation domain-containing protein  28.63 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5789  hypothetical protein  27.73 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0262  hypothetical protein  25.82 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2415  sporulation domain-containing protein  25.94 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0398  sporulation-like  29.96 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  39.42 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0396  sporulation related  30.74 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  36.75 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0246  Sporulation domain protein  25.44 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.202943 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0026  hypothetical protein  28.63 
 
 		 201 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  34.31 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5139  hypothetical protein  29.13 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45370  cell division protein FtsN  38.89 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0574  sporulation domain-containing protein  31.82 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  27.84 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0462  Sporulation domain protein  33.78 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26415  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  30.47 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  36.19 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  34.31 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0333  Sporulation domain protein  32.53 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68871  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0534  sporulation domain-containing protein  24.49 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0136  Sporulation domain protein  30.83 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3865  sporulation related  41.79 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2696  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  25.76 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193267  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  34.57 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  35.14 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2969  sporulation domain-containing protein  31.71 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0344  sporulation domain-containing protein  32.43 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.777067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0384  sporulation domain-containing protein  31.71 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.548534  normal  0.309068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2935  sporulation domain-containing protein  31.71 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2832  sporulation domain-containing protein  31.71 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0354  sporulation repeat-containing protein  33.33 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  31.94 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0415  sporulation domain-containing protein  32.43 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0085  sporulation repeat-containing protein  31.4 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0591  sporulation repeat-containing protein  31.4 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.809015  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6263  cell division protein  31.08 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  32.88 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2306  sporulation related  31.08 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2920  sporulation domain-containing protein  31.08 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417345  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3098  sporulation repeat-containing protein  31.4 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1998  sporulation repeat-containing protein  31.4 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787505  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0409  cell division protein  31.4 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0429  cell division protein  31.4 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2290  sporulation repeat-containing protein  31.4 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0721  Sporulation domain protein  31.58 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  32.61 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2238  hypothetical protein  24.91 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.460395 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4489  sporulation related  30.77 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3090  hypothetical protein  30.66 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0401965  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0442  sporulation related  30.83 
 
 		 185 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  28.38 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3702  sporulation domain-containing protein  34.62 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4229  sporulation domain-containing protein  32.14 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156013 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0819  sporulation domain-containing protein  24.73 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0831164  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1976  sporulation domain-containing protein  35.62 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1945  hypothetical protein  24.28 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.749075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2113  Sporulation domain protein  39.34 
 
 		 194 aa  53.1  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  29.49 
 
 		 254 aa  52.4  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0924  sporulation domain-containing protein  35.25 
 
 		 709 aa  52.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.993892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  36.62 
 
 		 352 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  30.33 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2783  putative FtsN cell division protein  34.25 
 
 		 176 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.892232 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0167  cell division protein FtsN  34.06 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  31.15 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  31.15 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0601  sporulation related  22.89 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.141318  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4190  sporulation related  31.18 
 
 		 176 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0295  sporulation domain-containing protein  21.32 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3763  sporulation domain-containing protein  30.86 
 
 		 199 aa  50.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.007756  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4428  sporulation domain-containing protein  32.39 
 
 		 190 aa  49.3  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  32 
 
 		 218 aa  48.9  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4367  putative cell division protein FtsN  32.39 
 
 		 191 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2012  hypothetical protein  28.74 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2007  hypothetical protein  28.74 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0199  sporulation related  23.35 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.499859  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  28.74 
 
 		 290 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  32.23 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  27.66 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0181  cell division protein FtsN  38.57 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  32.95 
 
 		 345 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3796  cell division protein FtsN  37.88 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1673  hypothetical protein  26.55 
 
 		 168 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.559277  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0532  sporulation domain-containing protein  32.5 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00323787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  32.5 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1686  sporulation domain-containing protein  30.88 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  34.72 
 
 		 210 aa  46.2  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03518  Sporulation related  35.59 
 
 		 192 aa  45.8  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.775864  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  25.68 
 
 		 268 aa  45.8  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  36.62 
 
 		 339 aa  45.4  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4791  cell division protein FtsN  45.1 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000221043 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>