More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1011 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  100 
 
 
352 aa  694    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  45.6 
 
 
324 aa  229  7e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  51.42 
 
 
285 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  37.16 
 
 
290 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  34.01 
 
 
342 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  36.73 
 
 
311 aa  170  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  33.71 
 
 
342 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  35.03 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  32.61 
 
 
332 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  56.52 
 
 
257 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  33.62 
 
 
322 aa  159  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  51.37 
 
 
265 aa  159  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  46.84 
 
 
267 aa  159  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  33.54 
 
 
335 aa  159  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  59.84 
 
 
273 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  59.84 
 
 
273 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  49.03 
 
 
265 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  45.81 
 
 
260 aa  156  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  33.52 
 
 
333 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  40.86 
 
 
281 aa  155  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  32.87 
 
 
337 aa  155  9e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  31.38 
 
 
297 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  35.9 
 
 
297 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  39.11 
 
 
269 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  32.55 
 
 
342 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  42.93 
 
 
267 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  38.78 
 
 
264 aa  152  8e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  31.94 
 
 
293 aa  152  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  33.24 
 
 
333 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  48.94 
 
 
283 aa  151  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  33.23 
 
 
295 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  33.02 
 
 
333 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  47.52 
 
 
277 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  47.52 
 
 
277 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  47.52 
 
 
277 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  33.43 
 
 
284 aa  150  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  47.52 
 
 
277 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  47.52 
 
 
280 aa  149  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  47.52 
 
 
280 aa  149  9e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  47.52 
 
 
280 aa  149  9e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  32.64 
 
 
321 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  39.22 
 
 
270 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  48.08 
 
 
265 aa  146  6e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  48.08 
 
 
261 aa  146  6e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  48.3 
 
 
263 aa  146  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  37.93 
 
 
278 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  47.44 
 
 
415 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  33.44 
 
 
310 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  47.44 
 
 
417 aa  144  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  42.86 
 
 
260 aa  143  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  34.43 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  31.55 
 
 
394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  42.51 
 
 
381 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  42.94 
 
 
286 aa  136  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  34.38 
 
 
282 aa  136  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  33.67 
 
 
333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  48.03 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  48.68 
 
 
391 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  56.41 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  41.45 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  48.82 
 
 
423 aa  129  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  36.86 
 
 
409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  48.82 
 
 
249 aa  126  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  50.4 
 
 
258 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  52.63 
 
 
246 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  34.18 
 
 
322 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  37.76 
 
 
211 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  56.44 
 
 
251 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  37.76 
 
 
242 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  37.76 
 
 
242 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  37.76 
 
 
230 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  37.76 
 
 
211 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  37.76 
 
 
211 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  37.71 
 
 
264 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  37.76 
 
 
211 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3465  rare lipoprotein A  55.77 
 
 
250 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3267  rare lipoprotein A  41.67 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  37.24 
 
 
230 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  46.53 
 
 
240 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  49.57 
 
 
286 aa  116  6.9999999999999995e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  34.26 
 
 
318 aa  116  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  41.33 
 
 
230 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  48.7 
 
 
243 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3267  putative lipoprotein  55.77 
 
 
234 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  51.33 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3137  rare lipoprotein A  56.44 
 
 
250 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  31.31 
 
 
367 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  54.84 
 
 
270 aa  114  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  50 
 
 
160 aa  114  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  50 
 
 
160 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  52.48 
 
 
202 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  53.4 
 
 
162 aa  113  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  51.96 
 
 
206 aa  113  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  43.17 
 
 
279 aa  113  5e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  51.96 
 
 
206 aa  113  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  52.21 
 
 
200 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  50.43 
 
 
259 aa  113  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  47.5 
 
 
275 aa  113  6e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  47.5 
 
 
275 aa  113  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  46.09 
 
 
186 aa  112  7.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>