133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4489 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4489  sporulation related  100 
 
 
206 aa  407  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  62.33 
 
 
211 aa  235  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0333  Sporulation domain protein  59.62 
 
 
208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68871  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0415  sporulation domain-containing protein  54.84 
 
 
218 aa  217  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0344  sporulation domain-containing protein  58.17 
 
 
208 aa  209  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.777067  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0574  sporulation domain-containing protein  52.31 
 
 
225 aa  205  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0462  Sporulation domain protein  49.19 
 
 
245 aa  204  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26415  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  50.66 
 
 
229 aa  181  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  50.72 
 
 
210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3702  sporulation domain-containing protein  79.81 
 
 
289 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0136  Sporulation domain protein  35.59 
 
 
236 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4229  sporulation domain-containing protein  45.28 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156013 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  35.17 
 
 
236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  34.73 
 
 
246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  35.59 
 
 
238 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  30.83 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  30.59 
 
 
265 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1976  sporulation domain-containing protein  34.13 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3865  sporulation related  31.71 
 
 
209 aa  86.3  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0409  cell division protein  43.62 
 
 
286 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0085  sporulation repeat-containing protein  43.62 
 
 
282 aa  84.7  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0591  sporulation repeat-containing protein  43.62 
 
 
282 aa  84.7  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.809015  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3098  sporulation repeat-containing protein  43.62 
 
 
282 aa  84.7  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1998  sporulation repeat-containing protein  43.62 
 
 
282 aa  84.7  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787505  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0429  cell division protein  43.62 
 
 
286 aa  84.7  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2290  sporulation repeat-containing protein  43.62 
 
 
282 aa  84.7  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  43.01 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0384  sporulation domain-containing protein  48 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.548534  normal  0.309068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2935  sporulation domain-containing protein  48 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0354  sporulation repeat-containing protein  46.67 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  45.33 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2306  sporulation related  48 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2969  sporulation domain-containing protein  48 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2920  sporulation domain-containing protein  48 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417345  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  37.32 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2832  sporulation domain-containing protein  48 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6263  cell division protein  48 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  31.68 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2773  sporulation domain-containing protein  40 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521305  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0262  hypothetical protein  42.53 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  37.18 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  30.77 
 
 
248 aa  64.3  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  30.77 
 
 
248 aa  63.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02917  hypothetical protein  36.49 
 
 
293 aa  62.8  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  39.33 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0246  Sporulation domain protein  39.44 
 
 
194 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.202943 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2415  sporulation domain-containing protein  39.19 
 
 
213 aa  58.9  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799064  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66760  hypothetical protein  37.5 
 
 
231 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5789  hypothetical protein  37.5 
 
 
230 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0819  sporulation domain-containing protein  40 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0831164  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0721  Sporulation domain protein  38.67 
 
 
222 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0026  hypothetical protein  33.33 
 
 
201 aa  55.5  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0396  sporulation related  35.62 
 
 
231 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5139  hypothetical protein  34.25 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5090  sporulation domain protein  35.62 
 
 
232 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.153909  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0398  sporulation-like  32.48 
 
 
238 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4963  sporulation domain-containing protein  35.62 
 
 
232 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  37.14 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3090  hypothetical protein  32.88 
 
 
213 aa  52.4  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0401965  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45370  cell division protein FtsN  32.53 
 
 
264 aa  52.4  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5140  sporulation domain-containing protein  35.62 
 
 
232 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0910008  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0601  sporulation related  26.92 
 
 
229 aa  52  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.141318  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0375  sporulation domain-containing protein  34.25 
 
 
232 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2696  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  34.25 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193267  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4124  cell division protein FtsN, putative  28.57 
 
 
231 aa  50.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03518  Sporulation related  33.8 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.775864  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3674  sporulation domain-containing protein  29.36 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0549  sporulation domain-containing protein  27.97 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.45608  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4127  sporulation domain-containing protein  33.73 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187687  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3497  sporulation domain-containing protein  28.44 
 
 
231 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0455  sporulation domain-containing protein  28.44 
 
 
231 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0534  sporulation domain-containing protein  32.88 
 
 
224 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0442  sporulation related  24.59 
 
 
185 aa  48.9  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  35.71 
 
 
279 aa  48.5  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0199  sporulation related  33.33 
 
 
228 aa  48.5  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.499859  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0497  Sporulation domain protein  25.98 
 
 
238 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0473  sporulation domain-containing protein  25.98 
 
 
238 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3846  sporulation domain-containing protein  25.98 
 
 
238 aa  48.1  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4367  putative cell division protein FtsN  30.67 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2113  Sporulation domain protein  30.43 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3358  sporulation related  26.72 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3763  sporulation domain-containing protein  26.02 
 
 
199 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.007756  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  34.04 
 
 
223 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  36.07 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0295  sporulation domain-containing protein  27.15 
 
 
275 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001747  cell division protein  31.94 
 
 
144 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3780  sporulation domain-containing protein  33.78 
 
 
191 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287293  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  32.63 
 
 
228 aa  46.2  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0532  sporulation domain-containing protein  32.39 
 
 
188 aa  46.2  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00323787  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0494  sporulation domain-containing protein  26.85 
 
 
238 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  33.33 
 
 
352 aa  45.8  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2249  putative cell division protein FtsN  29.33 
 
 
183 aa  46.2  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  31.51 
 
 
218 aa  45.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4190  sporulation related  34.85 
 
 
176 aa  45.4  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4428  sporulation domain-containing protein  28.17 
 
 
190 aa  45.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  31.11 
 
 
269 aa  45.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2238  hypothetical protein  24.49 
 
 
263 aa  44.7  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.460395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  34.85 
 
 
342 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0705  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 
372 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  29.57 
 
 
243 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>