123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0344 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0344  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
208 aa  410  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.777067  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0333  Sporulation domain protein  98.56 
 
 
208 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68871  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0415  sporulation domain-containing protein  73.52 
 
 
218 aa  279  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  60.09 
 
 
211 aa  230  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0574  sporulation domain-containing protein  66.35 
 
 
225 aa  228  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  59.57 
 
 
229 aa  214  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4489  sporulation related  59.33 
 
 
206 aa  202  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0462  Sporulation domain protein  50.2 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26415  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  51.66 
 
 
210 aa  174  9e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  37.5 
 
 
246 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4229  sporulation domain-containing protein  46.88 
 
 
213 aa  135  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156013 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  34.17 
 
 
236 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0136  Sporulation domain protein  33.91 
 
 
236 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  35.86 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  32.68 
 
 
260 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  32.94 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3702  sporulation domain-containing protein  51.57 
 
 
289 aa  121  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1976  sporulation domain-containing protein  36.06 
 
 
204 aa  118  7.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  37.56 
 
 
202 aa  99.8  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3865  sporulation related  29.49 
 
 
209 aa  87  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0085  sporulation repeat-containing protein  46.67 
 
 
282 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0591  sporulation repeat-containing protein  46.67 
 
 
282 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.809015  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3098  sporulation repeat-containing protein  46.67 
 
 
282 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1998  sporulation repeat-containing protein  46.67 
 
 
282 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787505  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0409  cell division protein  46.67 
 
 
286 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0429  cell division protein  46.67 
 
 
286 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2290  sporulation repeat-containing protein  46.67 
 
 
282 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0354  sporulation repeat-containing protein  46.67 
 
 
282 aa  85.5  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2935  sporulation domain-containing protein  48 
 
 
298 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0384  sporulation domain-containing protein  48 
 
 
292 aa  85.1  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.548534  normal  0.309068 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2306  sporulation related  48 
 
 
297 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2969  sporulation domain-containing protein  48 
 
 
295 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2920  sporulation domain-containing protein  48 
 
 
297 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2832  sporulation domain-containing protein  48 
 
 
301 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6263  cell division protein  48 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  46.15 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  30.2 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  45.57 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  45.57 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02917  hypothetical protein  41.77 
 
 
293 aa  72  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  32.91 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  43.33 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  32.05 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0262  hypothetical protein  41.38 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5090  sporulation domain protein  39.73 
 
 
232 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.153909  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45370  cell division protein FtsN  39.76 
 
 
264 aa  62  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4963  sporulation domain-containing protein  39.73 
 
 
232 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0398  sporulation-like  39 
 
 
238 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5140  sporulation domain-containing protein  39.73 
 
 
232 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0910008  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0026  hypothetical protein  31.9 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0375  sporulation domain-containing protein  38.36 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2773  sporulation domain-containing protein  32.33 
 
 
222 aa  58.9  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521305  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66760  hypothetical protein  37.39 
 
 
231 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5789  hypothetical protein  38.38 
 
 
230 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0819  sporulation domain-containing protein  34.94 
 
 
214 aa  58.2  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0831164  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2113  Sporulation domain protein  31.46 
 
 
194 aa  57.4  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5139  hypothetical protein  36.11 
 
 
231 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0534  sporulation domain-containing protein  36.9 
 
 
224 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0246  Sporulation domain protein  31.25 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.202943 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0721  Sporulation domain protein  38.67 
 
 
222 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0396  sporulation related  34.72 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  36.59 
 
 
218 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3846  sporulation domain-containing protein  27.34 
 
 
238 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3763  sporulation domain-containing protein  33.8 
 
 
199 aa  51.6  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.007756  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0473  sporulation domain-containing protein  27.34 
 
 
238 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0497  Sporulation domain protein  27.34 
 
 
238 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3090  hypothetical protein  34.25 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0401965  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0199  sporulation related  29.89 
 
 
228 aa  50.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.499859  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  36.25 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3674  sporulation domain-containing protein  32.47 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  37.5 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0494  sporulation domain-containing protein  27.54 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3497  sporulation domain-containing protein  34.78 
 
 
231 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0455  sporulation domain-containing protein  34.78 
 
 
231 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  26.95 
 
 
279 aa  49.7  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0601  sporulation related  26.89 
 
 
229 aa  49.3  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.141318  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  36.73 
 
 
228 aa  48.9  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  30.97 
 
 
360 aa  48.9  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2415  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 
213 aa  48.5  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799064  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4124  cell division protein FtsN, putative  33.33 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2696  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  33.73 
 
 
186 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193267  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0442  sporulation related  28.05 
 
 
185 aa  47.4  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0549  sporulation domain-containing protein  31.08 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.45608  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0295  sporulation domain-containing protein  27.78 
 
 
275 aa  47  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  42.62 
 
 
346 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  34.88 
 
 
290 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  30.32 
 
 
360 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0181  cell division protein FtsN  34.29 
 
 
257 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0532  sporulation domain-containing protein  30 
 
 
188 aa  46.2  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00323787  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001747  cell division protein  32.84 
 
 
144 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  37.5 
 
 
345 aa  45.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  36.51 
 
 
259 aa  45.1  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03518  Sporulation related  30.99 
 
 
192 aa  45.1  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.775864  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4367  putative cell division protein FtsN  30.67 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0167  cell division protein FtsN  32.86 
 
 
257 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0705  sporulation domain-containing protein  34.72 
 
 
372 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0879  Sporulation domain protein  25.21 
 
 
265 aa  44.7  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000399203  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3780  sporulation domain-containing protein  30.99 
 
 
191 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287293  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1851  rare lipoprotein A  28.39 
 
 
360 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000580444  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  33.73 
 
 
474 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>