139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3761 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  100 
 
 		 290 aa  557  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  49.08 
 
 		 313 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  51.32 
 
 		 332 aa  232  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  55.82 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  45.75 
 
 		 315 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2685  sporulation related  52.22 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  53.67 
 
 		 280 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  53.33 
 
 		 280 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  43.14 
 
 		 268 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  71.13 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  34.51 
 
 		 279 aa  102  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  34.35 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  30.57 
 
 		 215 aa  90.9  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  26.57 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1686  sporulation domain-containing protein  51.95 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  27.86 
 
 		 228 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4379  sporulation domain-containing protein  31.02 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  32.09 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  31.25 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  30.26 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2132  Sporulation domain protein  26.67 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1808  Sporulation domain protein  27.84 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  34.34 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  32.28 
 
 		 275 aa  67  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  27.6 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  30.65 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4791  cell division protein FtsN  34.15 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000221043 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6837  Sporulation domain protein  33.09 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  29.76 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  28.52 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  30.51 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  30.18 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  29.89 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  32.33 
 
 		 224 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  30.85 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  28.52 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  57.81 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3167  sporulation related  41.57 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.085105  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  31.34 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2035  sporulation domain-containing protein  35.62 
 
 		 533 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524131 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1045  Sporulation domain protein  38.61 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.827032 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  38.55 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  62.96 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  31.09 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  31.09 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  36 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  65.38 
 
 		 489 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  39.44 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  55 
 
 		 926 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  36 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  36 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  27.41 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3796  cell division protein FtsN  32.28 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  28.95 
 
 		 224 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  25.77 
 
 		 194 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3565  sporulation domain-containing protein  52.27 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1716  sporulation repeat-containing protein  42.47 
 
 		 241 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.448122  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1654  sporulation repeat-containing protein  42.47 
 
 		 241 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1863  sporulation repeat-containing protein  42.47 
 
 		 241 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2440  sporulation and cell division repeat-containing protein  42.47 
 
 		 241 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.371782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0534  sporulation repeat-containing protein  42.47 
 
 		 241 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2302  sporulation and cell division repeat-containing protein  42.47 
 
 		 241 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1910  hypothetical protein  30.12 
 
 		 214 aa  52.8  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.504476 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4404  sporulation related  52.27 
 
 		 278 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3963  sporulation domain-containing protein  52.27 
 
 		 278 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.832057 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  33.96 
 
 		 210 aa  52.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0764  sporulation repeat-containing protein  42.47 
 
 		 271 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  61.29 
 
 		 630 aa  52  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2120  hypothetical protein  52.27 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0535891 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  31.45 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3353  sporulation domain-containing protein  52.27 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4617  sporulation domain-containing protein  52.27 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.602598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3858  sporulation domain-containing protein  52.27 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2301  sporulation related  32.95 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38359  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0181  cell division protein FtsN  33.33 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5090  sporulation domain protein  32.14 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.153909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  40.98 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4963  sporulation domain-containing protein  32.14 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4229  sporulation domain-containing protein  38.1 
 
 		 213 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156013 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  34.67 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0167  cell division protein FtsN  31.58 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  32.35 
 
 		 250 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02917  hypothetical protein  36.11 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  35.29 
 
 		 224 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  39.34 
 
 		 345 aa  49.7  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  34.67 
 
 		 224 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  28 
 
 		 250 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  34.67 
 
 		 224 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  28 
 
 		 250 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  26.19 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  26.44 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0924  sporulation domain-containing protein  35.48 
 
 		 709 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.993892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  66 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5140  sporulation domain-containing protein  30.64 
 
 		 232 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0910008  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  36 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  36.62 
 
 		 211 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  36 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  36 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  36 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  36 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>