46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2132 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2132  Sporulation domain protein  100 
 
 		 286 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1808  Sporulation domain protein  91.35 
 
 		 288 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1978  hypothetical protein  73.08 
 
 		 273 aa  287  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  44.64 
 
 		 245 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2301  sporulation related  43.73 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38359  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1045  Sporulation domain protein  36.19 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.827032 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  36.78 
 
 		 279 aa  122  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4379  sporulation domain-containing protein  38.98 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6837  Sporulation domain protein  37.45 
 
 		 307 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0684  sporulation repeat-containing protein  44.17 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233168  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2120  hypothetical protein  44.14 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0535891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3565  sporulation domain-containing protein  44.95 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  34.68 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0534  sporulation repeat-containing protein  57.14 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1863  sporulation repeat-containing protein  57.14 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1716  sporulation repeat-containing protein  57.14 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.448122  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1654  sporulation repeat-containing protein  57.14 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0764  sporulation repeat-containing protein  57.14 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2302  sporulation and cell division repeat-containing protein  57.14 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2440  sporulation and cell division repeat-containing protein  57.14 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.371782  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  30.21 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3858  sporulation domain-containing protein  63.46 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3353  sporulation domain-containing protein  63.46 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3963  sporulation domain-containing protein  43.66 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.832057 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4404  sporulation related  43.66 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2876  hypothetical protein  54.84 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  28.46 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  27.07 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  24.82 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4617  sporulation domain-containing protein  43.66 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.602598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  31.47 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  31.47 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  28.38 
 
 		 223 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  51.11 
 
 		 271 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1686  sporulation domain-containing protein  57.5 
 
 		 249 aa  50.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  48.89 
 
 		 290 aa  49.3  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  29.15 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  32.37 
 
 		 394 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  26.89 
 
 		 233 aa  47  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  25.22 
 
 		 232 aa  45.8  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  29.33 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  26.32 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  24.62 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2966  rare lipoprotein A  29.2 
 
 		 381 aa  43.9  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2685  sporulation related  28.14 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  27.67 
 
 		 223 aa  42.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>