71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1045 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1045  Sporulation domain protein  100 
 
 
268 aa  527  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.827032 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  68.64 
 
 
279 aa  351  5.9999999999999994e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  41.41 
 
 
245 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2132  Sporulation domain protein  34.39 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664286  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1808  Sporulation domain protein  38.03 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2301  sporulation related  40.97 
 
 
245 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38359  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1978  hypothetical protein  34.16 
 
 
273 aa  96.3  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6837  Sporulation domain protein  34.41 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1716  sporulation repeat-containing protein  32.42 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.448122  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0534  sporulation repeat-containing protein  32.42 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1863  sporulation repeat-containing protein  32.42 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1654  sporulation repeat-containing protein  32.42 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4379  sporulation domain-containing protein  31.45 
 
 
306 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772559  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  33.33 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  34.7 
 
 
215 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3565  sporulation domain-containing protein  39.08 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  28.18 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  31.12 
 
 
228 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2876  hypothetical protein  44.74 
 
 
312 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  32.47 
 
 
239 aa  63.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4404  sporulation related  37.68 
 
 
278 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3353  sporulation domain-containing protein  37.78 
 
 
285 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36909  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3963  sporulation domain-containing protein  37.68 
 
 
278 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.832057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  37.5 
 
 
290 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  56.1 
 
 
313 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  37.21 
 
 
315 aa  56.2  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3858  sporulation domain-containing protein  38.96 
 
 
282 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0764  sporulation repeat-containing protein  39.24 
 
 
271 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2302  sporulation and cell division repeat-containing protein  39.24 
 
 
241 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2440  sporulation and cell division repeat-containing protein  39.24 
 
 
241 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.371782  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  27.32 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  29.6 
 
 
224 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  28.7 
 
 
223 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2120  hypothetical protein  37.68 
 
 
281 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0535891 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  35.62 
 
 
332 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  27.32 
 
 
346 aa  52.8  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4617  sporulation domain-containing protein  37.68 
 
 
273 aa  52.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.602598  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  25.24 
 
 
221 aa  52.8  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2685  sporulation related  30.83 
 
 
257 aa  52.4  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  27.13 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  27.23 
 
 
218 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0684  sporulation repeat-containing protein  42.31 
 
 
271 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233168  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1976  sporulation domain-containing protein  31.18 
 
 
204 aa  50.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  27.68 
 
 
268 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1910  hypothetical protein  27.45 
 
 
214 aa  50.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.504476 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  26.79 
 
 
189 aa  49.7  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  25.63 
 
 
194 aa  49.3  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  28.14 
 
 
224 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  28.14 
 
 
224 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  28.88 
 
 
224 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1090  rare lipoprotein A  25 
 
 
388 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499967  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  28.1 
 
 
280 aa  47  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  28.1 
 
 
280 aa  47  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  34.21 
 
 
202 aa  46.6  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  27.71 
 
 
224 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0901  sporulation domain-containing protein  34.43 
 
 
328 aa  45.8  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1025  hypothetical protein  34.43 
 
 
328 aa  46.2  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.469684  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  26.61 
 
 
201 aa  46.2  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  31.33 
 
 
345 aa  45.8  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1686  sporulation domain-containing protein  53.66 
 
 
249 aa  45.8  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  26.19 
 
 
265 aa  45.4  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0930  sporulation domain-containing protein  28.95 
 
 
740 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0247822 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  25.51 
 
 
250 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  29.63 
 
 
198 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  29.87 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  22.37 
 
 
221 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  26.14 
 
 
246 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  23.3 
 
 
209 aa  43.5  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  30.7 
 
 
423 aa  42.7  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  24.49 
 
 
250 aa  42.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  25.96 
 
 
206 aa  42  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>