87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2685 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2685  sporulation related  100 
 
 
257 aa  495  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  53.7 
 
 
255 aa  224  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  43.24 
 
 
332 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  42.09 
 
 
315 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  39.37 
 
 
313 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  42.19 
 
 
280 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  41.86 
 
 
280 aa  148  7e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  42.86 
 
 
268 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  67.62 
 
 
290 aa  132  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  56.64 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  30.77 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  30.83 
 
 
215 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  30.08 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  29.1 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  28.22 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1045  Sporulation domain protein  31.95 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.827032 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1686  sporulation domain-containing protein  41.56 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4379  sporulation domain-containing protein  29.6 
 
 
306 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772559  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  30.45 
 
 
230 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2132  Sporulation domain protein  29.31 
 
 
286 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664286  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6837  Sporulation domain protein  26.91 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  25.86 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1910  hypothetical protein  31.98 
 
 
214 aa  55.8  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.504476 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  29.17 
 
 
233 aa  55.5  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  27.88 
 
 
189 aa  55.5  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  29.36 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2876  hypothetical protein  30.08 
 
 
312 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  27.27 
 
 
285 aa  53.1  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  27.62 
 
 
224 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3167  sporulation related  33.55 
 
 
349 aa  52.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.085105  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1808  Sporulation domain protein  26.75 
 
 
288 aa  52.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  23.81 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  26.23 
 
 
224 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  26.29 
 
 
223 aa  49.3  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  31.01 
 
 
250 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  27.35 
 
 
232 aa  48.9  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  26.21 
 
 
224 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  26.02 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  26.02 
 
 
224 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  28.79 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  26.55 
 
 
206 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  26.51 
 
 
218 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2035  sporulation domain-containing protein  30.14 
 
 
533 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.524131 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  27.4 
 
 
210 aa  47  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  31.94 
 
 
303 aa  46.6  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  30.2 
 
 
254 aa  46.2  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03518  Sporulation related  30 
 
 
192 aa  46.2  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.775864  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  28.89 
 
 
275 aa  46.2  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1654  sporulation repeat-containing protein  40.91 
 
 
241 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3565  sporulation domain-containing protein  40.91 
 
 
278 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0534  sporulation repeat-containing protein  40.91 
 
 
241 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  29.69 
 
 
265 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1716  sporulation repeat-containing protein  40.91 
 
 
241 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.448122  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2302  sporulation and cell division repeat-containing protein  40.91 
 
 
241 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2440  sporulation and cell division repeat-containing protein  40.91 
 
 
241 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.371782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1863  sporulation repeat-containing protein  40.91 
 
 
241 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  42.59 
 
 
345 aa  45.8  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0764  sporulation repeat-containing protein  40.91 
 
 
271 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0684  sporulation repeat-containing protein  40.91 
 
 
271 aa  45.4  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233168  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4404  sporulation related  40.91 
 
 
278 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3963  sporulation domain-containing protein  40.91 
 
 
278 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.832057 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3353  sporulation domain-containing protein  40.91 
 
 
285 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36909  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4617  sporulation domain-containing protein  40.91 
 
 
273 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.602598  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  26.43 
 
 
201 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2120  hypothetical protein  40.91 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0535891 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  25.55 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  40.74 
 
 
346 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  26.88 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  25.53 
 
 
220 aa  43.9  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  25.53 
 
 
220 aa  43.9  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  25.53 
 
 
220 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  25 
 
 
279 aa  43.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  25.53 
 
 
220 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  25.53 
 
 
220 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  25.53 
 
 
220 aa  43.9  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  25.53 
 
 
220 aa  43.9  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  25.53 
 
 
220 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  25.53 
 
 
220 aa  43.9  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  26.5 
 
 
203 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  23.32 
 
 
214 aa  43.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  26.61 
 
 
250 aa  42.7  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  27.27 
 
 
267 aa  42.7  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  27.05 
 
 
245 aa  42.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  30.12 
 
 
265 aa  42.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02917  hypothetical protein  30.14 
 
 
293 aa  42.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  27.1 
 
 
274 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3858  sporulation domain-containing protein  38.75 
 
 
282 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>