76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1619 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
209 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  53.4 
 
 
206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  54.59 
 
 
201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  48.84 
 
 
221 aa  192  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  47.98 
 
 
223 aa  188  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  44.44 
 
 
259 aa  176  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  42 
 
 
250 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  43.37 
 
 
250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  41.6 
 
 
250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  41.6 
 
 
250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  41.29 
 
 
265 aa  170  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  43.58 
 
 
208 aa  159  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  42.21 
 
 
232 aa  158  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  33.94 
 
 
214 aa  129  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  32.04 
 
 
285 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1967  sporulation domain-containing protein  34.12 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  35.35 
 
 
189 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  35.68 
 
 
240 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  35.68 
 
 
240 aa  122  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  34.96 
 
 
245 aa  121  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  31.97 
 
 
246 aa  121  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  36.28 
 
 
224 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  34.89 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  31.23 
 
 
250 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  34.35 
 
 
224 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  34.5 
 
 
224 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  34.2 
 
 
224 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  34.2 
 
 
224 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  34.55 
 
 
220 aa  115  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  34.55 
 
 
220 aa  115  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  34.55 
 
 
220 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  34.55 
 
 
220 aa  115  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  34.55 
 
 
220 aa  115  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  34.55 
 
 
220 aa  115  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  34.55 
 
 
220 aa  115  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  34.55 
 
 
220 aa  115  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  34.55 
 
 
220 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  32.23 
 
 
275 aa  114  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  35.07 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  34.11 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  34.3 
 
 
197 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  33.49 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  59.76 
 
 
274 aa  109  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  59.76 
 
 
274 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  32.93 
 
 
249 aa  108  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  57.32 
 
 
281 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  32.86 
 
 
198 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  25.83 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  26.91 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  25.42 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  26.01 
 
 
218 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  28.79 
 
 
186 aa  62.8  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  25.23 
 
 
205 aa  62.4  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  25.23 
 
 
203 aa  62  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  26.85 
 
 
221 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  23.44 
 
 
174 aa  61.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1297  hypothetical protein  25.2 
 
 
262 aa  59.7  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  25 
 
 
214 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34170  Sporulation related repeat protein  36.25 
 
 
205 aa  58.9  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  25 
 
 
214 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  24.04 
 
 
194 aa  58.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1666  sporulation related  37.5 
 
 
217 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3813  hypothetical protein  36.25 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2023  hypothetical protein  35 
 
 
219 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  27.27 
 
 
210 aa  56.2  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  37.66 
 
 
223 aa  55.1  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1296  hypothetical protein  22.8 
 
 
256 aa  54.7  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1900  argininosuccinate synthase  31.37 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1758  hypothetical protein  32.89 
 
 
424 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  33.75 
 
 
216 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  31.25 
 
 
204 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  32.99 
 
 
574 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  32.99 
 
 
574 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  25 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1240  sporulation domain-containing protein  28.21 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.873348 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  24.58 
 
 
245 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.369037 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>