84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1090 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
332 aa  623  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  55.42 
 
 
255 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  47.48 
 
 
290 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  42.54 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  41.28 
 
 
315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2685  sporulation related  43.84 
 
 
257 aa  170  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  42.48 
 
 
280 aa  153  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  42.18 
 
 
280 aa  152  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  64.58 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  48.65 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1686  sporulation domain-containing protein  48.61 
 
 
249 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  27.78 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  28.62 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  30.73 
 
 
215 aa  64.3  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  49.28 
 
 
1261 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  27.94 
 
 
281 aa  53.9  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  28.2 
 
 
275 aa  53.9  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  50 
 
 
630 aa  54.3  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  30.19 
 
 
285 aa  54.3  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1808  Sporulation domain protein  35.42 
 
 
288 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  25 
 
 
218 aa  52.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  28.53 
 
 
274 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  27.51 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  27.95 
 
 
274 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1045  Sporulation domain protein  48.78 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.827032 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4379  sporulation domain-containing protein  47.73 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772559  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  28.81 
 
 
259 aa  50.4  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  36.36 
 
 
228 aa  50.4  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  49.3 
 
 
484 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  47.89 
 
 
489 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  26.56 
 
 
233 aa  50.1  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0924  sporulation domain-containing protein  36.11 
 
 
709 aa  50.1  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.993892  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3565  sporulation domain-containing protein  47.73 
 
 
278 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4829  hypothetical protein  57.78 
 
 
5185 aa  49.7  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.27186 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  50 
 
 
444 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0534  sporulation repeat-containing protein  45.45 
 
 
241 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1863  sporulation repeat-containing protein  45.45 
 
 
241 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1654  sporulation repeat-containing protein  45.45 
 
 
241 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1716  sporulation repeat-containing protein  45.45 
 
 
241 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.448122  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2302  sporulation and cell division repeat-containing protein  45.45 
 
 
241 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0684  sporulation repeat-containing protein  45.45 
 
 
271 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233168  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4617  sporulation domain-containing protein  44.9 
 
 
273 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.602598  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  36 
 
 
224 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3858  sporulation domain-containing protein  47.73 
 
 
282 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0764  sporulation repeat-containing protein  45.45 
 
 
271 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  30.46 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  49.33 
 
 
926 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3298  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 
602 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  25.25 
 
 
250 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1170  sporulation domain-containing protein  28.47 
 
 
300 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  41.98 
 
 
423 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1240  sporulation domain-containing protein  40.62 
 
 
228 aa  47.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.873348 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  26.69 
 
 
250 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  39.29 
 
 
345 aa  46.2  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  33.72 
 
 
224 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3167  sporulation related  38.67 
 
 
349 aa  46.2  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.085105  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  29.52 
 
 
260 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2132  Sporulation domain protein  35.11 
 
 
286 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664286  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  40.74 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  29.29 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 
333 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02917  hypothetical protein  34.33 
 
 
293 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  27.78 
 
 
1567 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  35.71 
 
 
230 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4229  sporulation domain-containing protein  34.88 
 
 
213 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  34.26 
 
 
214 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  32.97 
 
 
224 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  32.53 
 
 
189 aa  43.5  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  34.33 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  35 
 
 
223 aa  43.5  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  33.87 
 
 
254 aa  43.1  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  36.59 
 
 
245 aa  43.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  34.92 
 
 
224 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  34.92 
 
 
224 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  31.34 
 
 
248 aa  42.7  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6837  Sporulation domain protein  41.18 
 
 
307 aa  42.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2290  sporulation repeat-containing protein  27.72 
 
 
282 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0429  cell division protein  27.72 
 
 
286 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0409  cell division protein  27.72 
 
 
286 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1998  sporulation repeat-containing protein  27.72 
 
 
282 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787505  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3098  sporulation repeat-containing protein  27.72 
 
 
282 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0354  sporulation repeat-containing protein  26.25 
 
 
282 aa  42.7  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0591  sporulation repeat-containing protein  27.72 
 
 
282 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.809015  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0085  sporulation repeat-containing protein  27.72 
 
 
282 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>