80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2304 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 221 aa  441  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  54.59 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  54.33 
 
 		 201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  48.84 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  45.38 
 
 		 250 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  45.97 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  42.28 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  44.54 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  43.7 
 
 		 259 aa  176  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  43.35 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  44.76 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  44.76 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  41.18 
 
 		 274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  39.78 
 
 		 281 aa  169  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  43.09 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  42.92 
 
 		 208 aa  154  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  36.18 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  38.59 
 
 		 245 aa  145  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  39.19 
 
 		 220 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  39.19 
 
 		 220 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  39.19 
 
 		 220 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  39.19 
 
 		 220 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  39.19 
 
 		 220 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  39.19 
 
 		 220 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  39.19 
 
 		 220 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  39.19 
 
 		 220 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  39.19 
 
 		 220 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  38.98 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  38.98 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  38.91 
 
 		 275 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  35.34 
 
 		 285 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  37.44 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  37.44 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  39.42 
 
 		 189 aa  138  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  37 
 
 		 224 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  37.07 
 
 		 233 aa  138  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  36.73 
 
 		 224 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  37 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  36.36 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  35.34 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  37.14 
 
 		 198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  36.84 
 
 		 197 aa  126  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  36.36 
 
 		 197 aa  125  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1967  sporulation domain-containing protein  33.18 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  33.33 
 
 		 214 aa  122  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  35.02 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  34.86 
 
 		 204 aa  113  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  28.37 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  28.9 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  24.06 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  25.36 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  24.88 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  27.78 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  26.67 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1297  hypothetical protein  25.9 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  26.07 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2023  hypothetical protein  25.7 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1666  sporulation related  30.33 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  27.27 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  27.57 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3813  hypothetical protein  27.62 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1296  hypothetical protein  26.1 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  23.65 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  27.14 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1900  argininosuccinate synthase  28.31 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34170  Sporulation related repeat protein  37.66 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  26.85 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  32 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1758  hypothetical protein  30.77 
 
 		 424 aa  48.5  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  25 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2012  hypothetical protein  33.58 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2007  hypothetical protein  33.58 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  23.24 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  25.32 
 
 		 279 aa  45.1  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1045  Sporulation domain protein  22.37 
 
 		 268 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.827032 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3216  sporulation domain-containing protein  31.08 
 
 		 140 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  24.88 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  44.68 
 
 		 574 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  44.68 
 
 		 574 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  28.97 
 
 		 267 aa  42.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>