70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2462 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  484  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2301  sporulation related  70 
 
 
245 aa  285  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38359  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2132  Sporulation domain protein  43.25 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664286  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1808  Sporulation domain protein  43.84 
 
 
288 aa  181  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1045  Sporulation domain protein  40.53 
 
 
268 aa  135  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.827032 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1978  hypothetical protein  40.07 
 
 
273 aa  133  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  37.71 
 
 
279 aa  128  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0684  sporulation repeat-containing protein  35.27 
 
 
271 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233168  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  33.49 
 
 
215 aa  89.7  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  33.33 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  28.51 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0764  sporulation repeat-containing protein  41.41 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3565  sporulation domain-containing protein  48.19 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4617  sporulation domain-containing protein  43.56 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.602598  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  24.78 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6837  Sporulation domain protein  51.39 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4404  sporulation related  47.89 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3963  sporulation domain-containing protein  47.89 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.832057 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3353  sporulation domain-containing protein  52 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36909  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1716  sporulation repeat-containing protein  54 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.448122  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0534  sporulation repeat-containing protein  54 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2440  sporulation and cell division repeat-containing protein  54 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.371782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1863  sporulation repeat-containing protein  54 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1654  sporulation repeat-containing protein  54 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4379  sporulation domain-containing protein  40.91 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772559  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2302  sporulation and cell division repeat-containing protein  54 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2876  hypothetical protein  50 
 
 
312 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  25.57 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3858  sporulation domain-containing protein  48.61 
 
 
282 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  25.18 
 
 
268 aa  62.4  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  37.21 
 
 
290 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2120  hypothetical protein  47.89 
 
 
281 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0535891 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2685  sporulation related  27.39 
 
 
257 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  30.22 
 
 
346 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0901  sporulation domain-containing protein  27.96 
 
 
328 aa  53.1  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  31.94 
 
 
280 aa  52.8  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1025  hypothetical protein  27.96 
 
 
328 aa  52.8  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.469684  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  31.94 
 
 
280 aa  52.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1686  sporulation domain-containing protein  50 
 
 
249 aa  49.3  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  26.32 
 
 
240 aa  48.9  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  26.32 
 
 
240 aa  48.9  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  26.9 
 
 
189 aa  48.9  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  28.06 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  27.03 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  30.14 
 
 
315 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  26.94 
 
 
205 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3167  sporulation related  33.33 
 
 
349 aa  47.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.085105  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  25.75 
 
 
245 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  23.85 
 
 
223 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  26.7 
 
 
201 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1910  hypothetical protein  26.26 
 
 
214 aa  46.2  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.504476 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0352  sporulation related  33.8 
 
 
265 aa  45.8  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000773302 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  22.32 
 
 
233 aa  45.8  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  25.12 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  27.98 
 
 
203 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  25.45 
 
 
221 aa  43.9  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0924  sporulation domain-containing protein  31.94 
 
 
709 aa  43.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.993892  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  23.64 
 
 
224 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  36.59 
 
 
332 aa  42.7  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  24.58 
 
 
209 aa  42.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4791  cell division protein FtsN  29.13 
 
 
312 aa  42.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000221043 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  24.09 
 
 
224 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  24.09 
 
 
224 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  27.55 
 
 
211 aa  42.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  23.26 
 
 
224 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  26.45 
 
 
310 aa  42  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2035  sporulation domain-containing protein  28.38 
 
 
533 aa  42.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.524131 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  23.7 
 
 
210 aa  42  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  23.39 
 
 
208 aa  42  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  26.72 
 
 
279 aa  42  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>