82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2982 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
201 aa  400  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  61.65 
 
 
206 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  54.59 
 
 
209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  54.33 
 
 
221 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  46.36 
 
 
223 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  44.57 
 
 
259 aa  162  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  41.83 
 
 
250 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  43.48 
 
 
250 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  43.54 
 
 
208 aa  158  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  42.46 
 
 
250 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  38.87 
 
 
265 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  40.57 
 
 
281 aa  155  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  42.06 
 
 
250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  46.12 
 
 
232 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  38.69 
 
 
274 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  36.24 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  37.99 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  37.99 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  40.18 
 
 
224 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  37.55 
 
 
224 aa  131  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  35.65 
 
 
233 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  34.41 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1967  sporulation domain-containing protein  38.05 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  34.16 
 
 
246 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  34.44 
 
 
240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  35.04 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  35.04 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  35.04 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  35.04 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  35.04 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  34.44 
 
 
240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  40 
 
 
189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  35.04 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  35.04 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  35.04 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  35.04 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  33.74 
 
 
245 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  33.96 
 
 
214 aa  123  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  38.1 
 
 
197 aa  122  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  37.14 
 
 
197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  37.32 
 
 
198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  34.47 
 
 
203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  34.42 
 
 
204 aa  108  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  57.69 
 
 
274 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  44.68 
 
 
285 aa  89  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  44.19 
 
 
275 aa  85.5  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  40.19 
 
 
249 aa  85.5  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  26.7 
 
 
205 aa  64.7  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  28.19 
 
 
221 aa  63.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  26.7 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  23.23 
 
 
174 aa  63.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  26.55 
 
 
215 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  24.54 
 
 
218 aa  58.5  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2023  hypothetical protein  25.99 
 
 
219 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  25.89 
 
 
223 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  30.48 
 
 
204 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1296  hypothetical protein  23.98 
 
 
256 aa  52.8  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  28.07 
 
 
210 aa  51.6  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  25.67 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  26.24 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  26.15 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  32.04 
 
 
230 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34170  Sporulation related repeat protein  32.47 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  23.71 
 
 
221 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  24.62 
 
 
194 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  27.49 
 
 
215 aa  48.9  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  25.45 
 
 
216 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1297  hypothetical protein  24.89 
 
 
262 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  26.7 
 
 
245 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  31 
 
 
290 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1045  Sporulation domain protein  26.17 
 
 
268 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.827032 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1758  hypothetical protein  39.29 
 
 
424 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2012  hypothetical protein  25.45 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  25 
 
 
279 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2007  hypothetical protein  25.45 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  30.34 
 
 
574 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  30.34 
 
 
574 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3216  sporulation domain-containing protein  31.65 
 
 
140 aa  42.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  38.36 
 
 
267 aa  42.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  26.34 
 
 
228 aa  41.6  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1240  sporulation domain-containing protein  38.18 
 
 
228 aa  41.6  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.873348 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0924  sporulation domain-containing protein  32.89 
 
 
709 aa  41.6  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.993892  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>