87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1078 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  100 
 
 
189 aa  375  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  51.74 
 
 
197 aa  184  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  52.74 
 
 
197 aa  183  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  48.02 
 
 
198 aa  174  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  39.42 
 
 
221 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1967  sporulation domain-containing protein  42.03 
 
 
205 aa  138  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  38.35 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  40 
 
 
201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  35.35 
 
 
209 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  37.56 
 
 
208 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  38.35 
 
 
206 aa  122  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  36.04 
 
 
223 aa  122  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  34.94 
 
 
250 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  33.87 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  32.93 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  34.85 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  34.53 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  33.62 
 
 
220 aa  115  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  33.62 
 
 
220 aa  115  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  32.53 
 
 
250 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  33.62 
 
 
220 aa  115  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  33.62 
 
 
220 aa  115  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  33.62 
 
 
220 aa  115  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  33.62 
 
 
220 aa  115  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  33.62 
 
 
220 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  33.62 
 
 
220 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  33.62 
 
 
220 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  34.75 
 
 
240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  34.75 
 
 
240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  30.8 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  33.19 
 
 
233 aa  113  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  31.91 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  36.15 
 
 
203 aa  105  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  32.42 
 
 
214 aa  101  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  46.99 
 
 
259 aa  82  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  40.2 
 
 
275 aa  77.8  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  42 
 
 
274 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  42 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  42.71 
 
 
274 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  41.53 
 
 
246 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  50 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  41.56 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  41.56 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  41.56 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  41.56 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  54.17 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  35.83 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  31 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  31 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1758  hypothetical protein  40.26 
 
 
424 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  27.09 
 
 
194 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  25.67 
 
 
174 aa  62  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  30.85 
 
 
215 aa  58.9  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  27.73 
 
 
221 aa  58.2  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  27.83 
 
 
223 aa  54.7  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  27.88 
 
 
214 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  27.4 
 
 
214 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  24.77 
 
 
221 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  26.5 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2685  sporulation related  34.52 
 
 
257 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  33.68 
 
 
186 aa  49.3  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  26.9 
 
 
245 aa  48.9  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  25 
 
 
255 aa  48.5  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  25.35 
 
 
216 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  26.6 
 
 
204 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  34.18 
 
 
267 aa  47.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  36.11 
 
 
254 aa  47.8  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1900  argininosuccinate synthase  25.68 
 
 
224 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  23.92 
 
 
210 aa  47  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1297  hypothetical protein  25 
 
 
262 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1045  Sporulation domain protein  26.32 
 
 
268 aa  45.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.827032 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  27.27 
 
 
260 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  27.94 
 
 
271 aa  45.1  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  24.41 
 
 
215 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  31.94 
 
 
280 aa  45.1  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  32.31 
 
 
290 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  30.56 
 
 
280 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1296  hypothetical protein  31.88 
 
 
256 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  30.14 
 
 
313 aa  42.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0807  sporulation related  27.68 
 
 
204 aa  42.4  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  32.69 
 
 
574 aa  42.4  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  32.69 
 
 
574 aa  42.4  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34170  Sporulation related repeat protein  32.05 
 
 
205 aa  42  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2023  hypothetical protein  23.47 
 
 
219 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  27.37 
 
 
268 aa  42  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  32.81 
 
 
332 aa  41.2  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  32.39 
 
 
346 aa  41.2  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>