72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0776 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
279 aa  545  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1045  Sporulation domain protein  68.2 
 
 
268 aa  338  5e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.827032 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  37.71 
 
 
245 aa  128  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2132  Sporulation domain protein  38.26 
 
 
286 aa  118  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664286  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1808  Sporulation domain protein  33.46 
 
 
288 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  34.03 
 
 
255 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2301  sporulation related  38.82 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38359  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1978  hypothetical protein  33.07 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6837  Sporulation domain protein  32.81 
 
 
307 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2876  hypothetical protein  32.42 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  33.18 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  31.88 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  26.09 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2120  hypothetical protein  50 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0535891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3565  sporulation domain-containing protein  67.44 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4404  sporulation related  67.44 
 
 
278 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3963  sporulation domain-containing protein  67.44 
 
 
278 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.832057 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3353  sporulation domain-containing protein  67.44 
 
 
285 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36909  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4379  sporulation domain-containing protein  60.47 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772559  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  31.02 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  29.02 
 
 
228 aa  60.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  45.31 
 
 
313 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  58.54 
 
 
290 aa  58.9  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  53.7 
 
 
271 aa  58.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  30.89 
 
 
274 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2685  sporulation related  30.77 
 
 
257 aa  55.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  29.92 
 
 
274 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0534  sporulation repeat-containing protein  37.14 
 
 
241 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1716  sporulation repeat-containing protein  37.14 
 
 
241 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.448122  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2302  sporulation and cell division repeat-containing protein  37.68 
 
 
241 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2440  sporulation and cell division repeat-containing protein  37.14 
 
 
241 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.371782  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0764  sporulation repeat-containing protein  37.68 
 
 
271 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1654  sporulation repeat-containing protein  37.14 
 
 
241 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1863  sporulation repeat-containing protein  37.14 
 
 
241 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  30.8 
 
 
265 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3858  sporulation domain-containing protein  35.14 
 
 
282 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0684  sporulation repeat-containing protein  36.23 
 
 
271 aa  52.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233168  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4617  sporulation domain-containing protein  36.23 
 
 
273 aa  52.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.602598  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  30.29 
 
 
250 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  27.23 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1090  rare lipoprotein A  30 
 
 
388 aa  50.8  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499967  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1686  sporulation domain-containing protein  57.89 
 
 
249 aa  50.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  28.05 
 
 
280 aa  49.7  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  42.68 
 
 
489 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  26.88 
 
 
246 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  28.05 
 
 
280 aa  49.3  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  26.17 
 
 
221 aa  48.5  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1976  sporulation domain-containing protein  32.89 
 
 
204 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  26.5 
 
 
346 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  28.1 
 
 
250 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  22.66 
 
 
210 aa  47  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  55.93 
 
 
630 aa  46.6  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  27 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2966  rare lipoprotein A  26.44 
 
 
381 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  28.36 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1910  hypothetical protein  30.23 
 
 
214 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.504476 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  25.32 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  25 
 
 
205 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0901  sporulation domain-containing protein  25.76 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  26.21 
 
 
345 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1025  hypothetical protein  25.25 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.469684  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  29.3 
 
 
218 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  25 
 
 
203 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1943  sporulation related protein  34.41 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.932522  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  28.63 
 
 
250 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  25 
 
 
201 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  26.48 
 
 
206 aa  43.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0705  sporulation domain-containing protein  30.77 
 
 
372 aa  42.7  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  25.23 
 
 
208 aa  42.7  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  28.95 
 
 
202 aa  42.7  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  52.63 
 
 
926 aa  42.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  46.88 
 
 
444 aa  42  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>