166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4771 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
315 aa  603  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  51.86 
 
 
313 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  48.1 
 
 
255 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  54.23 
 
 
280 aa  226  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  47.03 
 
 
332 aa  225  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  53.92 
 
 
280 aa  225  9e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2685  sporulation related  43.99 
 
 
257 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  71.43 
 
 
271 aa  129  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  60.19 
 
 
290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  32.98 
 
 
239 aa  93.2  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2153  DedD protein  48.78 
 
 
268 aa  90.9  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.453662  normal  0.165352 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  29.67 
 
 
279 aa  85.5  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  29.02 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3058  Sporulation domain protein  31.82 
 
 
230 aa  77  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  70 
 
 
444 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  42.86 
 
 
489 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  75 
 
 
926 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  68.66 
 
 
484 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  50.85 
 
 
630 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  71.01 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  30.42 
 
 
285 aa  65.1  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  55.29 
 
 
1261 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  44.93 
 
 
928 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  31.52 
 
 
250 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  30.9 
 
 
274 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  29.41 
 
 
275 aa  61.6  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2035  sporulation domain-containing protein  36.99 
 
 
533 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.524131 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4791  cell division protein FtsN  31.54 
 
 
312 aa  60.8  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000221043 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  31.29 
 
 
281 aa  59.7  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66760  hypothetical protein  31.67 
 
 
231 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  29.26 
 
 
250 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  28.25 
 
 
249 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  30 
 
 
233 aa  57  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  41.18 
 
 
279 aa  57  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1045  Sporulation domain protein  51.85 
 
 
268 aa  56.6  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.827032 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  34.38 
 
 
248 aa  57  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  37.5 
 
 
281 aa  56.6  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  37.5 
 
 
281 aa  56.6  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  31.36 
 
 
265 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  34.04 
 
 
2449 aa  56.2  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  31.29 
 
 
198 aa  55.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  29.15 
 
 
274 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  28.21 
 
 
223 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02917  hypothetical protein  35.06 
 
 
293 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3565  sporulation domain-containing protein  35.24 
 
 
278 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4404  sporulation related  35.24 
 
 
278 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3963  sporulation domain-containing protein  35.24 
 
 
278 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.832057 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3796  cell division protein FtsN  28.79 
 
 
280 aa  53.1  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  35.35 
 
 
210 aa  53.1  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4617  sporulation domain-containing protein  35.24 
 
 
273 aa  53.5  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.602598  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45370  cell division protein FtsN  31 
 
 
264 aa  53.1  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0181  cell division protein FtsN  35.82 
 
 
257 aa  52.8  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1910  hypothetical protein  41.98 
 
 
214 aa  52.8  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.504476 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  34.67 
 
 
303 aa  52.8  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1716  sporulation repeat-containing protein  45.45 
 
 
241 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.448122  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3167  sporulation related  40.26 
 
 
349 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.085105  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1654  sporulation repeat-containing protein  45.45 
 
 
241 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1863  sporulation repeat-containing protein  45.45 
 
 
241 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2440  sporulation and cell division repeat-containing protein  45.45 
 
 
241 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.371782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0534  sporulation repeat-containing protein  45.45 
 
 
241 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5789  hypothetical protein  30.3 
 
 
230 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0167  cell division protein FtsN  33.8 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  28.83 
 
 
238 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0764  sporulation repeat-containing protein  45.45 
 
 
271 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  30.97 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2302  sporulation and cell division repeat-containing protein  45.45 
 
 
241 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0352  sporulation related  36.62 
 
 
265 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000773302 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  35.53 
 
 
228 aa  50.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 
333 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3353  sporulation domain-containing protein  45.45 
 
 
285 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36909  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3858  sporulation domain-containing protein  45.45 
 
 
282 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  44.26 
 
 
346 aa  50.4  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  30.14 
 
 
248 aa  49.7  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0398  sporulation-like  32.35 
 
 
238 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1976  sporulation domain-containing protein  29.63 
 
 
204 aa  49.3  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4040  essential cell division protein FtsN  34.15 
 
 
344 aa  49.3  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  29.87 
 
 
248 aa  49.3  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1808  Sporulation domain protein  51.22 
 
 
288 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  34.25 
 
 
246 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2773  sporulation domain-containing protein  36.76 
 
 
222 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521305  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5090  sporulation domain protein  31.68 
 
 
232 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.153909  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5139  hypothetical protein  31.19 
 
 
231 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4423  essential cell division protein FtsN  33.73 
 
 
328 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4309  essential cell division protein FtsN  33.73 
 
 
334 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  40.98 
 
 
345 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  30.53 
 
 
260 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4425  essential cell division protein FtsN  33.73 
 
 
325 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  30.25 
 
 
202 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0462  Sporulation domain protein  37.33 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26415  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4339  essential cell division protein FtsN  33.73 
 
 
324 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0889614  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0721  Sporulation domain protein  36.49 
 
 
222 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  36.67 
 
 
214 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4493  essential cell division protein FtsN  33.73 
 
 
324 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  28.04 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4963  sporulation domain-containing protein  31.68 
 
 
232 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0924  sporulation domain-containing protein  33.71 
 
 
709 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.993892  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5140  sporulation domain-containing protein  31.68 
 
 
232 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0910008  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4165  essential cell division protein FtsN  34.15 
 
 
319 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4469  essential cell division protein FtsN  34.15 
 
 
319 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4085  cell division protein FtsN  34.15 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>