72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1493 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
265 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  91.61 
 
 
274 aa  483  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  90.15 
 
 
274 aa  475  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  77.3 
 
 
281 aa  410  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  73.06 
 
 
259 aa  345  5e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  66.05 
 
 
250 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  65.68 
 
 
250 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  62.96 
 
 
250 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  62.96 
 
 
250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  43.54 
 
 
223 aa  182  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  43.91 
 
 
232 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  43.35 
 
 
221 aa  176  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  41.29 
 
 
209 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  42.59 
 
 
206 aa  169  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  42.86 
 
 
208 aa  168  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  38.87 
 
 
201 aa  156  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  38.54 
 
 
285 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  35.77 
 
 
245 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  35.93 
 
 
240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  35.93 
 
 
240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  35.94 
 
 
249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  34.59 
 
 
275 aa  125  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  34.47 
 
 
250 aa  123  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  33.33 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  33.46 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  30.8 
 
 
189 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  34.09 
 
 
197 aa  111  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1967  sporulation domain-containing protein  31.54 
 
 
205 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  32.84 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  33.58 
 
 
233 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  31.82 
 
 
203 aa  106  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  30.97 
 
 
224 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  32.09 
 
 
224 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  32.09 
 
 
224 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  31.82 
 
 
197 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  27.86 
 
 
204 aa  87  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  42.67 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  42.67 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  42.67 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  42.67 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  42.67 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  42.67 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  42.67 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  42.67 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  42.67 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  39.05 
 
 
198 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  27.76 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  38.67 
 
 
224 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1296  hypothetical protein  27.17 
 
 
256 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  25.97 
 
 
218 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1297  hypothetical protein  25.82 
 
 
262 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  33.33 
 
 
203 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  25.67 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  33.33 
 
 
205 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  30.8 
 
 
279 aa  53.1  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1666  sporulation related  35.29 
 
 
217 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1900  argininosuccinate synthase  27.13 
 
 
224 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3813  hypothetical protein  34.12 
 
 
216 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  27.39 
 
 
223 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34170  Sporulation related repeat protein  31.71 
 
 
205 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  26.29 
 
 
255 aa  50.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  30.49 
 
 
221 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  30.15 
 
 
204 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  27.51 
 
 
332 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2023  hypothetical protein  31.71 
 
 
219 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1758  hypothetical protein  27.71 
 
 
424 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  31.71 
 
 
215 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  40.4 
 
 
239 aa  46.6  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  34.65 
 
 
254 aa  46.2  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  31.03 
 
 
186 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  38.46 
 
 
271 aa  42.7  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  26.89 
 
 
215 aa  42.7  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>