43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1512 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5504  hypothetical protein  57.1 
 
 		 1249 aa  1326    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4414  tetratricopeptide TPR_4 protein  63.68 
 
 		 1242 aa  1018    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.746828  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1127  tetratricopeptide TPR_4 protein  55.62 
 
 		 1247 aa  1262    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.541599 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1389  tetratricopeptide TPR_4 protein  61.27 
 
 		 1269 aa  1008    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.184088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3780  hypothetical protein  63.63 
 
 		 1306 aa  1001    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  100 
 
 		 1261 aa  2501    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1690  hypothetical protein  63.51 
 
 		 1280 aa  1007    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16649  normal  0.0936113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5048  tetratricopeptide TPR_4 protein  35.76 
 
 		 1127 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2567  hypothetical protein  32.48 
 
 		 1141 aa  375  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5541  TPR repeat-containing protein  35.7 
 
 		 1118 aa  375  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697284  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5158  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 1157 aa  376  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1941  hypothetical protein  31.61 
 
 		 1140 aa  370  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0500  tetratricopeptide TPR_4 protein  34.64 
 
 		 1112 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0931337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0463  tetratricopeptide TPR_4 protein  34.41 
 
 		 1108 aa  365  4e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0429  tetratricopeptide TPR_4 protein  34.1 
 
 		 1116 aa  360  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.564621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1437  tetratricopeptide TPR_4  32.59 
 
 		 959 aa  359  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  49.28 
 
 		 332 aa  60.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  51.92 
 
 		 501 aa  57  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  41.67 
 
 		 926 aa  57  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  35.39 
 
 		 630 aa  56.6  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  35.54 
 
 		 489 aa  56.2  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  34.81 
 
 		 484 aa  55.5  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4086  putative granule-associated protein  52.17 
 
 		 287 aa  53.5  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00010965  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4829  hypothetical protein  35.85 
 
 		 5185 aa  52.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4769  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.94 
 
 		 590 aa  52.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2832  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1131 aa  52.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  35.9 
 
 		 268 aa  51.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0525  hypothetical protein  42.68 
 
 		 334 aa  50.8  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2684  hypothetical protein  41.38 
 
 		 524 aa  51.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0188967  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3446  hypothetical protein  22.03 
 
 		 860 aa  51.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5311  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.33 
 
 		 602 aa  50.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  35.09 
 
 		 423 aa  48.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  41.25 
 
 		 444 aa  48.5  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  46.6 
 
 		 537 aa  47.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3005  hypothetical protein  40 
 
 		 570 aa  48.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520915  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5236  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.4 
 
 		 586 aa  47  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0586878 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  27.36 
 
 		 499 aa  46.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0549  hypothetical protein  32.86 
 
 		 501 aa  46.2  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3298  flagellar hook-length control protein  23 
 
 		 602 aa  46.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3399  hypothetical protein  49.41 
 
 		 347 aa  45.8  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.274598  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2504  ribonuclease  51.85 
 
 		 1084 aa  45.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2967  hypothetical protein  43.96 
 
 		 440 aa  45.1  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000478189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2756  hypothetical protein  43.96 
 
 		 440 aa  45.1  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00725843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>