18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4086 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4086  putative granule-associated protein  100 
 
 		 287 aa  514  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00010965  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3298  flagellar hook-length control protein  38.96 
 
 		 602 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0920  spore coat assembly protein SafA  38.89 
 
 		 538 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0760  hypothetical protein  16.56 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152814  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  45.22 
 
 		 484 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  32.26 
 
 		 778 aa  56.6  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  23.63 
 
 		 1394 aa  55.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  50 
 
 		 1261 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2528  spore coat assembly protein SafA  54.72 
 
 		 432 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  41.98 
 
 		 489 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0549  hypothetical protein  28.86 
 
 		 501 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5798  serine/threonine protein kinase  31.9 
 
 		 565 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  49.37 
 
 		 444 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  34.46 
 
 		 926 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4085  putative granule-associated protein  27.19 
 
 		 123 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000162145  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3648  hypothetical protein  31.01 
 
 		 1616 aa  42.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4084  putative granule-associated protein  30.43 
 
 		 123 aa  42.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000239516  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3009  enterotoxin  46.67 
 
 		 548 aa  42  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>