18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4414 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3780  hypothetical protein  81.28 
 
 		 1306 aa  1291    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  57.38 
 
 		 1261 aa  1342    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1690  hypothetical protein  80.07 
 
 		 1280 aa  1280    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16649  normal  0.0936113 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1389  tetratricopeptide TPR_4 protein  61.04 
 
 		 1269 aa  1004    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.184088  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5504  hypothetical protein  54.45 
 
 		 1249 aa  1253    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1127  tetratricopeptide TPR_4 protein  54.77 
 
 		 1247 aa  1221    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.541599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4414  tetratricopeptide TPR_4 protein  100 
 
 		 1242 aa  2459    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.746828  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1941  hypothetical protein  30.11 
 
 		 1140 aa  399  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5541  TPR repeat-containing protein  37.67 
 
 		 1118 aa  392  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697284  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5158  TPR repeat-containing protein  37.99 
 
 		 1157 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5048  tetratricopeptide TPR_4 protein  35.01 
 
 		 1127 aa  375  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2567  hypothetical protein  32.19 
 
 		 1141 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0500  tetratricopeptide TPR_4 protein  35.38 
 
 		 1112 aa  366  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0931337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0463  tetratricopeptide TPR_4 protein  35.34 
 
 		 1108 aa  365  4e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0429  tetratricopeptide TPR_4 protein  35.58 
 
 		 1116 aa  363  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.564621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1437  tetratricopeptide TPR_4  32.18 
 
 		 959 aa  354  7e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2832  hypothetical protein  29.13 
 
 		 1131 aa  241  8e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3446  hypothetical protein  21.29 
 
 		 860 aa  51.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>