16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2567 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2567  hypothetical protein  100 
 
 		 1141 aa  2268    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1941  hypothetical protein  32.48 
 
 		 1140 aa  439  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1127  tetratricopeptide TPR_4 protein  29.22 
 
 		 1247 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.541599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5504  hypothetical protein  31.86 
 
 		 1249 aa  392  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1389  tetratricopeptide TPR_4 protein  33.67 
 
 		 1269 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.184088  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  32.52 
 
 		 1261 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4414  tetratricopeptide TPR_4 protein  32.49 
 
 		 1242 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.746828  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1690  hypothetical protein  33.12 
 
 		 1280 aa  365  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16649  normal  0.0936113 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3780  hypothetical protein  33.73 
 
 		 1306 aa  361  5e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5158  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 1157 aa  349  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2832  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1131 aa  335  4e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0500  tetratricopeptide TPR_4 protein  30.26 
 
 		 1112 aa  331  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0931337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5048  tetratricopeptide TPR_4 protein  34.2 
 
 		 1127 aa  331  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0429  tetratricopeptide TPR_4 protein  30.56 
 
 		 1116 aa  329  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.564621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0463  tetratricopeptide TPR_4 protein  29.85 
 
 		 1108 aa  327  9e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5541  TPR repeat-containing protein  31.32 
 
 		 1118 aa  326  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>