23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5504 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1127  tetratricopeptide TPR_4 protein  55.65 
 
 		 1247 aa  1240    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.541599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4414  tetratricopeptide TPR_4 protein  59.48 
 
 		 1242 aa  953    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.746828  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3780  hypothetical protein  59.95 
 
 		 1306 aa  934    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  57.31 
 
 		 1261 aa  1333    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1690  hypothetical protein  59.4 
 
 		 1280 aa  934    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16649  normal  0.0936113 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1389  tetratricopeptide TPR_4 protein  55.99 
 
 		 1269 aa  1323    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.184088  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5504  hypothetical protein  100 
 
 		 1249 aa  2487    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2567  hypothetical protein  32.34 
 
 		 1141 aa  375  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5158  TPR repeat-containing protein  37.2 
 
 		 1157 aa  377  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5541  TPR repeat-containing protein  35.66 
 
 		 1118 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697284  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5048  tetratricopeptide TPR_4 protein  34.98 
 
 		 1127 aa  366  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1941  hypothetical protein  31.49 
 
 		 1140 aa  362  3e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0500  tetratricopeptide TPR_4 protein  33.41 
 
 		 1112 aa  360  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0931337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0429  tetratricopeptide TPR_4 protein  34.37 
 
 		 1116 aa  351  5e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.564621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0463  tetratricopeptide TPR_4 protein  33.84 
 
 		 1108 aa  349  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1437  tetratricopeptide TPR_4  32.35 
 
 		 959 aa  343  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2832  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1131 aa  259  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3446  hypothetical protein  26.18 
 
 		 860 aa  54.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  33.6 
 
 		 1454 aa  49.3  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  32.88 
 
 		 497 aa  47.8  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0027  hypothetical protein  54.72 
 
 		 273 aa  45.4  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  41.12 
 
 		 281 aa  45.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3766  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 		 428 aa  45.1  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>