16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1941 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1941  hypothetical protein  100 
 
 		 1140 aa  2235    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1437  tetratricopeptide TPR_4  38.47 
 
 		 959 aa  457  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2567  hypothetical protein  33.06 
 
 		 1141 aa  445  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5504  hypothetical protein  27.79 
 
 		 1249 aa  389  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  31.93 
 
 		 1261 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4414  tetratricopeptide TPR_4 protein  33.08 
 
 		 1242 aa  360  9e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.746828  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1389  tetratricopeptide TPR_4 protein  32.91 
 
 		 1269 aa  353  1e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.184088  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1127  tetratricopeptide TPR_4 protein  31.73 
 
 		 1247 aa  346  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.541599 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3780  hypothetical protein  32.17 
 
 		 1306 aa  342  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2832  hypothetical protein  27.26 
 
 		 1131 aa  287  8e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0500  tetratricopeptide TPR_4 protein  29.33 
 
 		 1112 aa  267  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0931337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5158  TPR repeat-containing protein  32.96 
 
 		 1157 aa  260  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0463  tetratricopeptide TPR_4 protein  33.83 
 
 		 1108 aa  244  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0429  tetratricopeptide TPR_4 protein  33.83 
 
 		 1116 aa  242  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.564621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1690  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1280 aa  64.3  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16649  normal  0.0936113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5048  tetratricopeptide TPR_4 protein  24.43 
 
 		 1127 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>