17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3780 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3780  hypothetical protein  100 
 
 		 1306 aa  2572    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  57.32 
 
 		 1261 aa  1331    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1690  hypothetical protein  88.26 
 
 		 1280 aa  1404    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16649  normal  0.0936113 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1389  tetratricopeptide TPR_4 protein  56.24 
 
 		 1269 aa  1293    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.184088  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4414  tetratricopeptide TPR_4 protein  72.05 
 
 		 1242 aa  1678    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.746828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5504  hypothetical protein  53.36 
 
 		 1249 aa  1233    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1127  tetratricopeptide TPR_4 protein  53.96 
 
 		 1247 aa  1211    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.541599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5541  TPR repeat-containing protein  37.39 
 
 		 1118 aa  385  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697284  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5048  tetratricopeptide TPR_4 protein  35.01 
 
 		 1127 aa  376  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5158  TPR repeat-containing protein  37.24 
 
 		 1157 aa  373  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2567  hypothetical protein  33.46 
 
 		 1141 aa  364  6e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0463  tetratricopeptide TPR_4 protein  35.18 
 
 		 1108 aa  362  4e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0429  tetratricopeptide TPR_4 protein  36.22 
 
 		 1116 aa  359  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.564621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0500  tetratricopeptide TPR_4 protein  35.6 
 
 		 1112 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0931337 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1941  hypothetical protein  31.63 
 
 		 1140 aa  358  2.9999999999999997e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1437  tetratricopeptide TPR_4  31.38 
 
 		 959 aa  342  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2832  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1131 aa  246  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>